NCBI BLAST云支持
有了NCBI BLAST云之后,设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像,Geneious可以与它连接起来。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析
按索引连接
连接序列列表并按索引对齐,而不是按照名称对齐,这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。
序列列表的CSV/TSV导出
将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV或TSV中,这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步分析。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
CRISPR Cpf1选项
添加了CRISPR-CPF1与5’PAM位点的支持。在A和T丰富序列中找到位点,并在体内具有更高的裂解效率。
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件,正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NCBI BLAST云支持
有了NCBI BLAST云之后,设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像,Geneious可以与它连接起来。
按索引连接
连接序列列表并按索引对齐,而不是按照名称对齐,这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。
序列列表的CSV/TSV导出
将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV或TSV中,这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步分析。
系统需求
Windows:
Windows 7, 8, 8.1, and 10
Note: These plugins are not supported on Windows: TopHat, Velvet Optimiser
Linux:
CentOS and Redhat 6 or higher, or Ubuntu Desktop LTS (14.04 and 16.04). Note that 32-bit linux is not supported for Geneious R10 and above. To run Geneious on Linux you also need the default desktop environment and all packages up to date with latest versions from the distribution repositories.
Geneious 分子生物学和NGS分析软件
NGS分析和基因组学
使用行业良好的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
Geneious新功能
新的特征包括改进的火山和PCA图用于表达分析,新的CRISPR Cpf1选项和限制站点的无表型突变分析。