Primer Premier PCR引物设计软件
SNP基因型分析的引物设计
使用Primer Premier,您可以从dbSNP加载序列,并将所设计的引物并置在SNP选定的两侧。数百个未发表的SNPs也可以通过在标准GenBank/ dbSNP文件中*它们作为变体特性来加载。在*SNPs之后,引物设计可以增强他们使用probe-based化学检测。
多重检测
对于多重实验,Primer Premier可以让您在批处理模式下启动引物搜索,然后检查设计的引物的交叉反应性,从而减少错误启动。
Primer Premier's search algorithm finds optimal PCR, multiplex and SNP genotyping primers with the most accurate melting temperature using the nearest neighbor thermodynamic algorithm. Primers are screened for secondary structures, dimers, hairpins, homologies and physical properties before reporting the best ones for your sequence, in ranked order. Equipped with a handy calculator, you can easily manipulate sequences and analyze the results of your primer design.
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户较终选择的引物。
标准PCR分析的引物设计
Primer Premier是设计和分析PCR引物的较全面的软件。Primer Premier通过利用较接近的热力学算法和较精确的熔化温度,找到较优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告较佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很*地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让Primer Premier为您挑选较好的引物。
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