使用期限*
许可形式单机和网络版
原产地丹麦
介质下载
适用平台Windows
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Program content:
Documentation for GPMAW is presented in the HELP section, the manual is available for download here.
![GPMAW数据处理](//l.b2b168.com/2019/07/18/10/201907181030361751814.jpg)
You deselect all regions by clicking once in the sequence without holding down the Shift key.
![GPMAW数据处理](//l.b2b168.com/2020/06/18/17/202006181725027765464.jpg)
以上显示的,可以有多种配置方式:
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。
序列窗口形成父窗口,从中可以创建大量派生子窗口:
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表:疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是,也有其他方法,如手动或半自动分裂。
以及精美的图片都可以轻松完成。
GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
![GPMAW数据处理](//l.b2b168.com/2020/06/18/16/202006181652223170044.jpg)
和*三个是从文献中得出的值(参考在线帮助和手册)。*二个选项基于游离残基的值。*四个和后一个选项基于当前选定的mass文件中的定义,必须选中才能使用这些值。
哪里使用这些值呢?
在各自的信息对话框中计算蛋白质和肽的PI值(从蛋白质或肽窗口,选择“蛋白质/肽信息)。如果选择了列选项,则在肽窗口中计算PI值。
模拟的2-D凝胶使用PI计算。
在DigestAlyzer中,可以选择Pi作为一个轴选项。
在肽窗口中报告电荷。
从蛋白质和肽窗口中调用电荷与ph窗口。
当前的局限
如果修改了带电残留物,则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值,则计算“正确”。如果一个界点被修改,它仍然会产生π/电荷。
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