保证正版 GPMAW正版软件
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产品描述

使用期限* 许可形式单机和网络版 原产地丹麦 介质下载 适用平台Windows
科学软件网提供的软件覆盖各个学科,软件数量达1000余款,满足各高校和企事业单位的科研需求。此外,科学软件网还提供软件培训和研讨会服务,目前视频课程达68门,涵盖34款软件。
和*三个是从文献中得出的值(参考在线帮助和手册)。*二个选项基于游离残基的值。*四个和后一个选项基于当前选定的mass文件中的定义,必须选中才能使用这些值。
哪里使用这些值呢?
在各自的信息对话框中计算蛋白质和肽的PI值(从蛋白质或肽窗口,选择“蛋白质/肽信息)。如果选择了列选项,则在肽窗口中计算PI值。
模拟的2-D凝胶使用PI计算。
在DigestAlyzer中,可以选择Pi作为一个轴选项。
在肽窗口中报告电荷。
从蛋白质和肽窗口中调用电荷与ph窗口。
当前的局限
如果修改了带电残留物,则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值,则计算“正确”。如果一个界点被修改,它仍然会产生π/电荷。
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The ‘Frames’ button toggles the display of an information frame to the left of the main sequence window. This window is dynamic, as the content of the frame will be updated when the content/selections are changed.
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A24The mass of the selected peptide and the region covered will be shown in the toolbar.
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肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等

肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:

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