使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
科学软件网销售软件达19年,有丰富的销售经验以及客户资源,提供的产品涵盖各个学科,包括经管,仿真,地球地理,生物化学,工程科学,排版及网络管理等。此外,我们还提供很多附加服务,如:现场培训、课程、解决方案、咨询服务等。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Multiplex ID
Sequencher 5.2或之后的用户使用基于BWA, GSNAP 或Velvet从头或基于参考组件的复用方法。复用方法快速而*。每个DNA样本都有与其相关的特定条形码。Sequencher可以阅读这些条形码并将数据分成不同的文件或‘bins’。Sequencher获取每个‘bin’中的序列,并为您执行汇编或对齐。Sequencher的Multiplex ID可与单端或成对端数据一起使用。对于成对的端数据,每个读数在5’端必须有相同的条形码,可以被识别为一对。您可以使用Tablet阅读器查看多路复用组件或对齐的结果。
SNP分析
筛选下一代测序所产生的数以百万计的读物在寻找候选SNPs时面临重大挑战。Maq和GSNAP算法都包括SNP筛选功能。Maq具有两级筛选过程,初搜索读取和参考序列之间的差异。接着,筛选初始结果的过滤步骤,寻找每列读取的相同类别的小数量,以及嵌入在高质量区域内的变体。综合报告中给出了结果,您还可以在Maqview或Tablet中查看结果。
使用GSNAP,SNP分析采取不同的方法,查看之前报告的SNPs以及新的候选SNPs。用户必须提供已知的SNPs列表以及读取和参考序列。GSNAP对所有主要和次要等位基因进行SNP耐受性排列。该算法使微小等位基因与错配区分开来。综合报告中给出了结果,您还可以在Tablet中查看结果。
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Your new primers are automatically tagged with a GenBank style feature key that makes them easier to see in an alignment. The primers are color-coded by direction for easy identification any time you use them AND you will never get them confused thanks to their naming convention.
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Sequencing MHC and mitochondrial genes for identification and population studies
Analysis of the PCR products of candidate genes.
Sequencing conserved genes across species for systematics.
Monitoring of viral genome sequence in conjunction with tracking resistance to antiviral agents or vaccines
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Sequencher Connections represents a new approach to performing multiple analyses on sequences or groups of sequences. Connections has expanded the power of Sequencher by allowing you to set up “channels” on which different analyses using different parameters or databases can be run. By simultaneously running analyses on multiple sequences or groups of sequences on different channels at the same time, Sequencher Connections can increase the speed with which you get results.
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