使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Multiplex ID
Sequencher 5.2或之后的用户使用基于BWA, GSNAP 或Velvet从头或基于参考组件的复用方法。复用方法快速而*。每个DNA样本都有与其相关的特定条形码。Sequencher可以阅读这些条形码并将数据分成不同的文件或‘bins’。Sequencher获取每个‘bin’中的序列，并为您执行汇编或对齐。Sequencher的Multiplex ID可与单端或成对端数据一起使用。对于成对的端数据，每个读数在5’端必须有相同的条形码，可以被识别为一对。您可以使用Tablet阅读器查看多路复用组件或对齐的结果。
SNP分析
筛选下一代测序所产生的数以百万计的读物在寻找候选SNPs时面临重大挑战。Maq和GSNAP算法都包括SNP筛选功能。Maq具有两级筛选过程，初搜索读取和参考序列之间的差异。接着，筛选初始结果的过滤步骤，寻找每列读取的相同类别的小数量，以及嵌入在高质量区域内的变体。综合报告中给出了结果，您还可以在Maqview或Tablet中查看结果。
使用GSNAP，SNP分析采取不同的方法，查看之前报告的SNPs以及新的候选SNPs。用户必须提供已知的SNPs列表以及读取和参考序列。GSNAP对所有主要和次要等位基因进行SNP耐受性排列。该算法使微小等位基因与错配区分开来。综合报告中给出了结果，您还可以在Tablet中查看结果。
BWA, Velvet, Maq, GSNAP and Tablet are only the start for Sequencher. If you are sequencing mixed populations, then combine the power of reference-guided-alignment with de novo assembly. Align reads to a reference and capture the unaligned reads for further rounds of reference-based alignment or de novo assembly.
Gene Codes has long been an innovator, investing in the R&D to develop powerful features for your DNA sequence analysis. Gene Codes developed the Assemble to Reference Sequence strategy that is widely used to speed up assembly and assign base-numbering systems and features to new data. The variance table was developed in the mid 1990's and became a key element first for forensic sequencing of mtDNA, and then for virtually all of our collaborators.
Your new primers are automatically tagged with a GenBank style feature key that makes them easier to see in an alignment. The primers are color-coded by direction for easy identification any time you use them AND you will never get them confused thanks to their naming convention.
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