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原产地美国
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适用平台Windows
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Prediction of CpG islands
Beacon Designer™ predicts CpG islands in accordance with Gardiner-Garden and Frommer guidelines. load the sequence in Beacon Designer™ and the program will automatically predict these regions. You can also specify the CpG regions manually in a sequence. The CpG islands are displayed in green in the Sequence view tab and the regions that are rich in GC are displayed in red.
![Beacon designer软件教程及学习班](//l.b2b168.com/2021/09/27/17/202109271731574995474.jpg)
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
具体而有效的设计:Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中,会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质:
TaqMan探针
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TaqMan® assays are ranked according to the proprietary ranking algorithm that weighs many factors considered important for primer and probe design.
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双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质:
TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针,帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP(单核苷酸多态性)。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸(LNA)取代TaqMan探针,这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化,Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析,用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer,通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸,以及未经处理的DNA序列,可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质,您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列,给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术,可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。
Scorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的,它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。
FRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。
2020年,北京天演融智软件有限公司申请高等教育司产学合作协同育人项目,“大数据”和“机器学习”师资培训项目,以及基于OBE的教考分离改革与教学评测项目已获得批准。我们将会跟更多的高校合作,产学融合协同育人。
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