正规代理 sequencher软件教程

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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
多序列比对
Clustal
从4.9版本开始，Clustal已经成为Sequencher一系列插件的一部分。它是一种被广泛使用的多序列比对程序，它通过确定一组序列中的所有成对排列来进行工作，构造一个树状图以近似相似的方式对序列进行分组，然后使用dendogram作为向导来执行该序列。您可以使用Clustal来直接从Sequencher项目窗口中排列您的序列。从一系列参数中选择控制对齐过程。
一旦完成对齐，您可以看到Sequencher中一个或多个重叠的结果，您还可以进行多种分析。
通过将Clustal与Sequencher的功能结合起来，将不同来源的多个序列排列在一起，加速您的集群的排列。后以不同的格式导出文件，如MSF、Phylip、NEXUS和FastA，在其他程序中使用或者简单地创建一致性并导出。

SNP Detection
Sequencher has several powerful tools to help you detect mutations and SNPs in your DNA sequences. You can use Sequencher for comparative sequence alignments among a group of sequences, or to compare 1 or more sequences to a Reference Sequence. Sequencher’s Call Secondary Peaks... function analyzes all of your sequences for potential heterozygotes. It’s easy to control the stringency that defines a heterozygote.

Once the process is complete and MUSCLE has built the alignment, you will see the results as a contig within Sequencher. Use Sequencher’s tools to annotate your alignment or export your alignment and place it into a special phylogenetics program.

The Assemble by Name tool allows you to choose a portion of the fragment name to act as a shared identifier, or "assembly handle." Sequencher then makes the selections and names the contigs automatically. Sequencher even supports Regular Expression matching for setting up the unique IDs!
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