ChromasPro使用教程 正版软件

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ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro适用于DNA序列组装项目，可达到几兆字节，并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器，比如ABI，454和Illumina下一代序列器中组装数据，如果有8GB的可用内存，则多可组装1,000,000个序列。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像，粘贴到文档或演示文稿中。
系统需求
Chromas is a free, simple, easy-to-use viewer and editor for chromatograms (traces) from automated Sanger sequencers. It has many format conversion options including batch processing functions to handle many files at once. As of version 2.6 it can use PeakTrace RP to enhance .ab1 files and extract more high-quality bases (this is a paid service). More…
ChromasPro is for assembly of sequence reads into contigs, with a graphical contig editor which displays aligned chromatograms. It also peforms general sequence analysis such as restriction enzyme mapping, open-reading-frame searches, and BLAST submission. More…

ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro适用于DNA序列组装项目，可达到几兆字节，并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器，比如ABI，454和Illumina下一代序列器中组装数据，如果有8GB的可用内存，则多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列，生成一致性并**模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
Open sequences in Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF and plain text formats.
Save sequences in .ab1, .scf, .fasta and .fastq formats.
Assemble overlapping sequences using a graphical interface, generate a consensus and highlight ambiguities for editing.
Use quality data to automatically remove low quality sequence for improved sequence assembly.
Use a reference sequence as a scaffold for assembly.
Generate restriction site and fragment maps, and list cutters, non-cutters and fragments.
Map open reading frames, aided by a G+C frame plot, and translate ORFs with one click.
Print chromatograms, restriction site and fragment maps, and open reading frame maps.
Perform nucleotide and protein BLAST searches through the NCBI web site.

ChromasPro DNA序列分析软件
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图，并列出切割，非切割和片段。
映射开放阅读框，由G+C框架图，并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图，限制位点和片段图，和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
Open sequences in Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF and plain text formats.
Save sequences in .ab1, .scf, .fasta and .fastq formats.
Assemble overlapping sequences using a graphical interface, generate a consensus and highlight ambiguities for editing.

ChromasPro具体功能
Ÿ 打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
Ÿ 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
Ÿ 使用图形界面组装重叠序列，生成一致性并**模糊性进行编辑。
Ÿ 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
Ÿ 使用参考序列作为组装的支架。
Ÿ 生成限制位点和片段图，并列出切割，非切割和片段。
Ÿ 映射开放阅读框，由G+C框架图，并用一次点击翻译ORFs。
Ÿ 打印色谱图，限制位点和片段图，和开放阅读框架图。
Ÿ 通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
Ÿ 与ClustalW接口执行多个对齐。
Ÿ 反向互补序列和色谱图。
Ÿ 通过匹配或优对齐搜索序列。
Ÿ 编辑核苷酸序列时显示翻译。
Ÿ 进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
Ÿ 绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
Ÿ 复制色谱切片的图像，粘贴到文档或演示文稿中。

ChromasPro是常用DNF序列分析软件Chromas的Pro版，适用于高达几兆碱基的DNA序列装配项目，以及基本的序列编辑和分析，它能够汇集来自Sanger测序仪（如ABI，454和Illumina下一代测序仪）的数据，如果有8Gb RAM可用，多可达1,000,000个序列，ChromasPro不免费，但是可以免费试用14天。
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