本地化服务 Beacon designer软件教程教你怎么用

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Beacon Designer 为qPCR检验设计和的oligos
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
utomate Your Real Time PCR Primer and Probe Design
Beacon Designer™ automates the design of real time primers and probes. It is used by molecular biologists worldwide to design successful real time PCR assays. It saves the time and the money involved in failed experiments. Beacon Designer™ is a flexible solution to your real time primer and probe design needs and pays for itself many times over.

The DNA sample is first treated with sodium bisulphite which converts the unmethylated cytosine bases to . The methylated cytosines on the other hand, remain unaffected. Methyl Specific primers are designed to anneal with bisulphite converted DNA. This sample is amplified by PCR replacing the  with thymine. A TaqMan® probe is then used to detect the methylated strand.

HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
Design specific and efficient oligos for all major qPCR assays
Design successful SYBR® Green, TaqMan®, HRMA Primers, MethyLight TaqMan®, LNA™ spiked TaqMan®, molecular beacons for both standard and NASBA® assays, Scorpions® and FRET assays by automatically interpreting BLAST results and avoiding template structures.

可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物，帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
SYBR® Green Primer Design
TaqMan® Probe Design
Multiplex Real Time PCR Assay Design
HRMA Primer Design
MethyLight TaqMan® Design
Molecular Beacon Design
NASBA® Assay Design
FRET Probe Design
Scorpions® Design
Avoiding Cross Homology- For Specific Oligo Design
Avoid Template Structures- Increase Primer Efficiency
Oligo Rating
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