sequencher使用教程 保证正版

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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
BLAST and Local-BLAST
BLAST这个工具经常被使用，但是有很多参数和选项，可能不会对每个内存都有影响。Sequencher Connections帮助您在更少的时间内做更多的事情，并比较您的结果。您想将结果与不同的设置进行比较吗？您想把您的搜索分成不同数据库供个人查询吗？也许近出版了一些东西，现在在数据库里，或者您知道一些关于您自己数据的新东西。连接允许您同时运行许多不同的数据库搜索，返回的结果与完成的速度一样快。然后，您可以保留所有的结果，并可以使用示意图。该示意图是一个平行的图形显示，把您的结果显示在所有分析中，对于一个序列来说，BLAST是不可能的。如果您能用一个序列来完成所有的事情，想想您在同一个会话中使用大量的序列时能做什么。


Primer-BLAST
使用Primer-BLAST分析序列并检查特。
并行分析-- 使用几组不同的设置集，在同一序列上运行，甚至在没有书写脚本的情况下，即使是不同的序列。单击一次就可以将数据保存到项目中。新的引物被自动标记为GenBank风格的特征键，使它们更*在对齐中看到。这些引物通过方向进行颜色编码，以便于在使用它们的任何时候进行识别，并且您永远不会因为它们的命名约定而混淆它们。


MUSCLE和Trees
当您想在DNA序列中寻找保护区域时，让MUSCLE来实现。它比许多其他多序列比对更快速，精度更高。MUSCLE操作简单，与Sequencher Connections一起不仅可以看到对齐的区域，还可以看到矩形或圆形树格式的结果。您可以在同一组序列上设置几个MUSCLE运行，每个分析（或通道）设置为使用不同的参数。您想将不同的数据集保持在一起，但是运行相同的MUSCLE参数吗？将它们添加到相同的连接会话中，因为会话中的每一行可以包含不同的序列组。MUSCLE运行在不同的通道和行，并且可以比较，给您一个特数据视角。

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Multiplex ID
Sequencher 5.2或之后的用户使用基于BWA, GSNAP 或Velvet从头或基于参考组件的复用方法。复用方法快速而*。每个DNA样本都有与其相关的特定条形码。Sequencher可以阅读这些条形码并将数据分成不同的文件或‘bins’。Sequencher获取每个‘bin’中的序列，并为您执行汇编或对齐。Sequencher的Multiplex ID可与单端或成对端数据一起使用。对于成对的端数据，每个读数在5’端必须有相同的条形码，可以被识别为一对。您可以使用Tablet阅读器查看多路复用组件或对齐的结果。


SNP分析
筛选下一代测序所产生的数以百万计的读物在寻找候选SNPs时面临重大挑战。Maq和GSNAP算法都包括SNP筛选功能。Maq具有两级筛选过程，初搜索读取和参考序列之间的差异。接着，筛选初始结果的过滤步骤，寻找每列读取的相同类别的小数量，以及嵌入在高质量区域内的变体。综合报告中给出了结果，您还可以在Maqview或Tablet中查看结果。


使用GSNAP，SNP分析采取不同的方法，查看之前报告的SNPs以及新的候选SNPs。用户必须提供已知的SNPs列表以及读取和参考序列。GSNAP对所有主要和次要等位基因进行SNP耐受性排列。该算法使微小等位基因与错配区分开来。综合报告中给出了结果，您还可以在Tablet中查看结果。

Sequencher always maintains two copies of your data, the edited and the originally imported data. You can undo all or a portion of your edits when you apply the Revert to Experimental Data command to a selection of sequences in your project or to a selection of bases in a sequence.

SANGER DNA ANALYSIS
Sequencher's extensive Sanger analysis features are the foundation it was built upon.  Customizable from start to finish there is no other program that offers you as much power as Sequencher.  With an easy to use interface that has been honed over 25 years, first time users will feel like a pro in minutes.  Everything from trimming reads, custom assembly and alignment algorithms, variation tables, summary reports, annotation; the list goes on and on.  Come see why Sequencher has been published in tens of thousands of research articles, and peer-reviewed journals.  Power with Simplicity.
科学软件网的客户涵盖产品涵盖教育、、交通、通信、金融、保险、电力等行业，并且为诸如北京大学、*大学、中国大学、中科院、农科院、社科院、环科院、国家、交通部、南方电网、国家电网、许继、南瑞等国内大型企事业单位、部委和科研机构长期提供相关产品。我们的品质，值得您信赖。
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