AlleleID软件百科 本地化服务

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Design qPCR and Microarray Assays for Related Organisms

AlleleID是一款旨在解决、病原体检测或物种的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心，AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
检测成功的复杂算法
高度特寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set"，该程序具创新性的特点之一，有助于设计少数量的等位基因特寡核苷酸引物和双标记探针，其特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个，降低化验成本。对于类群或跨种分析，当类群或类群高度不同时，该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物，AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种或类群特检测。




Real Time PCR VS Traditional PCR
Real time PCR allows for the detection of PCR product during the early phases of the reaction. This ability of measuring the reaction kinetics in the early phases of PCR provide a distinct advantage over traditional PCR detection. Traditional methods use gel electrophoresis for the detection of PCR amplification in the final phase or at end-point of the PCR reaction.

检测成功的复杂算法
高度特寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set"，该程序具创新性的特点之一，有助于设计少数量的等位基因特寡核苷酸引物和双标记探针，其特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个，降低化验成本。对于类群或跨种分析，当类群或类群高度不同时，该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物，AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种或类群特检测。
广泛支持实时或定量PCR检测和SNP/表达微阵列
AlleleID可以设计优的SYBR Green引物、TaqMan探针、TaqMan Minor Groove Bingding
(MGB)探针、FRET探针或者分子信标，用于实时定量PCR差异基因表达SNP基因型分类试验。您也可以设计实时PCR引物和双标记探针多达一万个序列在一个单一的运行SNP检测或表达微阵列。
设计Luminex xMAP试验 
基于Luminex’s xMAP技术，AlleleID可以设计应用于悬浮阵列系统的应变-微分多重分析设计。如果您研究的是密切相关的生物体，这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特引物延伸（ASPE）和DHA检测。
多路连接依赖探针扩增（MLPA）检测拷贝数和突变检测
AlleleID是设计MLPA合成探针或者由MRC Holland引入的多重连接依赖探针扩增技术的程序，当合适的工具包不可用时，研究人员能够扩展这项技术。这是一种快速增长的高通量基因图谱分析方法。可以检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。具有成本效益合适、敏感性高、特好和可再生性好等特点。
AlleleID为PamGene检测设计了mRNA特,DNA特和突变特MLPA探针。这将使PamChip用户在使用PamGene高精度检测平台时设计自己感兴趣的基因探针检测。结合这两种技术，拷贝数的变化和突变可以很*地在6小时内检测到。
2020年，北京天演融智软件有限公司申请高等教育司产学合作协同育人项目，“大数据”和“机器学习”师资培训项目，以及基于OBE的教考分离改革与教学评测项目已获得批准。我们将会跟更多的高校合作，产学融合协同育人。
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