使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
科学软件网是一个以引进国研软件，提供软件服务的营业网站，网站由北京天演融智软件有限公司创办，旨在为国内高校、科研院所和以研发为主的企业事业单位提供的科研软件及相关软件服务。截止目前，科学软件网已获得数百家国际软件公司正式授权，代理销售科研软件达一千余种，软件涵盖领域包括经管，仿真，地球地理，生物化学，工程科学，排版及网络管理等。同时，还提供培训、课程（包含34款软件，66门课程）、实验室解决方案和项目咨询等服务。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
甲基化研究
几十年来，DNA甲基化被认为在基因表达中起着重要的作用。当用亚硫酸氢盐处理DNA时，除非胞嘧啶甲基化，任何胞嘧啶都被转换成尿嘧啶。GSNAP将从亚硫酸氢盐处理的DNA测序获得的下一代测序读数校准为参考序列，以不掩盖真正错配的方式排列它们，但当用亚硫酸氢盐处理未甲基化DNA时仍然暴露发生的C到T失配。
RNA耐受性比对
GSNAP已经更新，现在包含A-G容错对齐模式。使用这种模式的情况下，您的mRNA可能已被ADAR基因编辑，使腺苷转化为肌苷。当测序时，I被视为G。该版本还引入了用于新的RNA耐受模式和甲基化分析的滞留和非滞留模式。当您的实验室协议允许5’到3’基因组读取和它们在每个链上的反向互补时，使用非搁浅模式。
查看器
Tablet是下一代序列比对的高性能查看器。以许多不同的模式查看和审查您的Maq, GSNAP,
BWA-MEN或Velvet结果，用不同的颜色和阅读方向**显示。获取个别读数和读取成对的信息，以及排列读取的堆叠以显示配对。Tablet可以控制转换、缩放以及**变异基，以便让您的阅读变得*。
MUSCLE
MUSCLE[2], a multiple-sequence alignment (MSA) program, joins the Sequencher 5.1 family of plugins. It joins Clustal, making it the second MSA program in Sequencher’s DNA-Seq Tools. Boasting both speed and accuracy, it compares very favorably [3] to other multiple-sequence alignment programs.
MUSCLE is said to have four major steps in its alignment process. The first step constructs a distance matrix between pairs of sequences using k-mer clustering, this is then converted into a tree. The second step uses this tree to guide a progressive alignment. In the final two steps, the MUSCLE algorithm tries a number of different methods to see if it is possible to improve the tree and hence the multiple alignment.
Once the process is complete and MUSCLE has built the alignment, you will see the results as a contig within Sequencher. Use Sequencher’s tools to annotate your alignment or export your alignment and place it into a special phylogenetics program.
Trim to Reference eliminates the ends of sequences that extend beyond an assembled Reference sequence.
Visualize the results using the Variance Table and its powerful reports.
科学软件网主要提供以下科学软件服务：
1、软件培训服务：与国内大学合作，聘请业内人士定期组织软件培训，截止目前，已成功举办软件培训四十多期，累计学员2000余人，不仅让学员掌握了软件使用技巧，加深了软件在本职工作中的应用深度，而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁；
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