本地化服务 Beacon designer正版软件如何用

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Dual Labeled Probe Design
Beacon Designer™ currently supports four probe based chemistries:

TaqMan® assays are ranked according to the proprietary ranking algorithm that weighs many factors considered important for primer and probe design.

You can use pre-designed or published or well proven forward or reverse primers and Beacon Designer™ will evaluate them for you. For example, for a given forward primer, Beacon Designer™ would design the reverse primer for SYBR® Green assays (and would design both the reverse primer and the TaqMan® probe for TaqMan® assays). All these primers are rated according to a ranking algorithm which determines how closely the specified primer pair and primer search parameters match the target values.

Designing MethyLight assays
Beacon Designer™ designs TaqMan® probes & methyl sensitive PCR primers. The MethyLight assays involves treatment of genomic DNA with sodium bisulphite followed by an alkaline treatment. Beacon Designer™ displays the corresponding bisulphite treated strand when the genomic sequence is provided. The program designs primers and TaqMan® probes for the specified CpG islands. You can also design suitable control primers and probes by designing them for unmethylated and untreated DNA sequences. These primers and TaqMan® probes are highly specific as they are designed by avoiding regions of significant cross homology identified by automatically interpreting BLAST search results. Template structures are also avoided during the design.
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