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AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
检测成功的复杂算法
高度特寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set",该程序具创新性的特点之一,有助于设计少数量的等位基因特寡核苷酸引物和双标记探针,其特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个,降低化验成本。对于类群或跨种分析,当类群或类群高度不同时,该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物,AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种或类群特检测。
广泛支持实时或定量PCR检测和SNP/表达微阵列
AlleleID可以设计优的SYBR Green引物、TaqMan探针、TaqMan Minor Groove Bingding
(MGB)探针、FRET探针或者分子信标,用于实时定量PCR差异基因表达SNP基因型分类试验。您也可以设计实时PCR引物和双标记探针多达一万个序列在一个单一的运行SNP检测或表达微阵列。
With ClustalW multiple sequence alignment at its core, AlleleID® can be used to design species identification/cross species probes for microarrays or real time PCR including SYBR® Green, TaqMan® MGB, TaqMan® probes, Molecular Beacons and real time PCR primers.
Species Identification Assays/Cross Species Assays/Allele Identification Assays
AlleleID® aligns sequences using ClustalW and analyzes conserved and species specific regions.
AlleleID® also designs mRNA specific, DNA specific and mutation specific MLPA probes for PamGene Arrays. This will enable PamChip® users designing their own probes to detect genes of interest using PamGene's high precision detection platform.
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