ChromasPro软件教程及百科

北京天演融智软件有限公司（科学软件网）前身是北京世纪天演科技有限公司，成立于2001年，专注为国内高校、科研院所和以研发为主的企事业单位提供科研软件和服务的国家。
1、Applied Biosystems .ab1，Staden Chromatogram(SCF和ZTR)，454 SFF，FASTA，FASTQ，EMBL，GenBank，SwissProt，GenPept，GCG RSF和纯文本格式中的笔序列。
2、以.ab1，.scf，.fasta和.fastq格式保存序列。
3、使用图形界面组合重叠序列，生成共识并**显示编辑的歧义。
4、使用质量数据自动低质量序列以改进序列组装。
5、使用参考序列作为装配的支架。
6、生成限制性站点和片段映射，并列出切割器，非切割器和片段。
7、在G + C框架图的帮助下绘制开放阅读框，并一键翻译ORF。
8、打印色谱图，限制性位点和片段图，以及打开阅读框架图。
9、通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
10、通过与ClustalW连接来执行多重对齐。
11、反向和补体序列和色谱图。
12、通过匹配或佳比对搜索序列。
13、编辑核苷酸序列时显示翻译。
14、执行反向翻译并绘制核苷酸简并。
15、绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
16、复制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。


ChromasPro适用于DNA序列组装项目，可达到几兆字节，并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器，比如ABI，454和Illumina下一代序列器中组装数据，如果有8GB的可用内存，则多可组装1,000,000个序列。

ChromasPro具体功能
 打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
 使用图形界面组装重叠序列，生成一致性并**模糊性进行编辑。
 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。

使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图，并列出切割，非切割和片段。
映射开放阅读框，由G+C框架图，并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图，限制位点和片段图，和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。


Fixed bug in undo of base X-coordinate dragging in the chromatogram editor.
Vector information is retained/updated after manual editing of a project member sequence.
Base ranges for maps and BLAST searches of the consensus sequence are now corrected for gaps.
Fixed division-by-zero error while displaying information on an empty project.
Fixed flicker while scrolling in the contig editor.

ChromasPro具体功能
Ÿ 打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
Ÿ 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
Ÿ 使用图形界面组装重叠序列，生成一致性并**模糊性进行编辑。
Ÿ 使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
Ÿ 使用参考序列作为组装的支架。
Ÿ 生成限制位点和片段图，并列出切割，非切割和片段。
Ÿ 映射开放阅读框，由G+C框架图，并用一次点击翻译ORFs。
Ÿ 打印色谱图，限制位点和片段图，和开放阅读框架图。
Ÿ 通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
Ÿ 与ClustalW接口执行多个对齐。
Ÿ 反向互补序列和色谱图。
Ÿ 通过匹配或优对齐搜索序列。
Ÿ 编辑核苷酸序列时显示翻译。
Ÿ 进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
Ÿ 绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
Ÿ 复制色谱切片的图像，粘贴到文档或演示文稿中。

ChromasPro是常用DNF序列分析软件Chromas的Pro版，适用于高达几兆碱基的DNA序列装配项目，以及基本的序列编辑和分析，它能够汇集来自Sanger测序仪（如ABI，454和Illumina下一代测序仪）的数据，如果有8Gb RAM可用，多可达1,000,000个序列，ChromasPro不免费，但是可以免费试用14天。
科学软件网不仅提供软件产品，更有多项附加服务免费提供，让您售后**！
http://turntech8843.b2b168.com