使用期限租赁
许可形式单机版
原产地新西兰
介质下载
适用平台Windows
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Mapping and de novo Assembly
Simply switch between industry leading algorithms for mapping and de novo assembly
Support for assembly of Sanger and NGS data, including Illumina, PacBio and Oxford Nanopore reads of any length, including paired-end reads and hybrid assemblies
Produce circular contigs when assembling microbial genomes, plasmids and other circular sequences
NGS分析和基因组学
使用的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件,正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和**显示。使用包括RAxML和PAUP在内的**评审算法构建系统树,并为公开准备的图形调整显示设置。
Collaboration
The right information at the right time, with a unified, central database, searchable across the organization
Scalability
Scale up quickly and efficiently, with additional capacity delivered on demand
Identification of Zika Virus – Explore a pipeline which allows accurate identification and analysis of low concentrations of ZIKV from high-throughput metagenomic data.
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