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    北京天演融智软件有限公司

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  • 公司认证: 营业执照已认证
  • 企业性质:私营企业
    成立时间:2006
  • 公司地址: 北京市 海淀区 北京市海淀区上地东路35号院1号楼3层1-312-318、1-312-319
  • 姓名: 王经理
  • 认证: 手机未认证 身份证未认证 微信已绑定

    版本升级 | DNASTAR Lasergene 18序列分析软件

  • 所属行业:IT 软件
  • 发布日期:2024-12-03
  • 阅读量:99
  • 价格:面议
  • 产品规格:不限
  • 产品数量:不限
  • 包装说明:不限
  • 发货地址:北京海淀  
  • 关键词:蛋白质序列,DNASTAR,基因测序

    版本升级 | DNASTAR Lasergene 18序列分析软件详细内容

    dnastar2024。12.2知乎

    DNAStar Lasergene 18已正式发布,该版本带来了重要的新功能和功能改进,包括对GenVision Pro的重大更新,GenVision Pro是我们用于跨多个样本可视化和分析基因组数据的应用程序。

    Lasergene 18的新功能包括:

    • 定相变异分析

    • 样本间的变体比较

    • 基因集富集分析(GSEA)

    • 自定义本地数据库中的搜索序列

    • 金门克隆

    • 用IQ树构建系统发育树

     

    定相变异分析

    Lasergene Genomics现在包括一个二倍体相位算法,可以用于分析与完整的人类基因组一样大的长读数据集。

    • 只需选择新的变异检测选项即可开始SeqMan NGen中的分阶段单倍型工作流程。

    • 在GenVision Pro的新基因组视图中查看整个基因组组装后的定相/非定相区域。

    • 使用GenVision Pro中的多个新轨道和选项,可视化和分析分相对齐读取,分相块,分相一致性和分相变体。

    • 导出分相共识块以获得感兴趣基因的母本和父本单倍体序列。

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    多个实验中的变体比较

    GenVision Pro现在能够全面比较多个实验的变体。

    • 将SeqMan NGen程序集、BAM和/或VCF文件导入GenVision Pro。

    • 基于维恩图、单个或多个基线对照、配对样本(例如,正常与**)、包含变体的样本或配对的较小百分比以及许多其他选项过滤变体。保存过滤器或将其设置为未来项目的默认过滤器。

    • 查看在SeqMan NGen中组装的人类样本的变体注释数据库信息。

    • 创建变量集,并将其与维恩图、并集、交集或包含每个变体的集合的较小百分比进行比较。

    • 将变体和变体集导出为CSV或以制表符分隔的文本文件。

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    基因集富集分析(GSEA)

    GSEA是针对RNA-Seq差异表达工作流程的一个专门版本,重点关注具有某些共性(例如调控、染色体位置或生物功能)的基因组。

    • 当满足DESEQ2或EdgeR分析的标准时,可在SeqMan NGen中访问GSEA计算方法。

    • 了解一组预定义的基因是否显示两种生物状态(例如表型)之间存在统计显着差异。

    • 可选择31种人类,19种小鼠,C. elegans和酵母分析选项中的任何一种。

    • 查看专门气泡图中的输出,其中列出了所选分析集中也存在差异表达的基因,以及显示上调和下调基因集的聚类图。

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    自定义本地数据库中的搜索序列

    GenVision Pro、Protean 3D、SeqMan Ultra和MegAlign Pro现在都提供了为本地BLAST搜索创建安全的本地序列数据库的能力。

    • 上传本地文件或从NCBI导入序列,有**过30个数据库可供用户选择。

    • 支持使用本地数据库管理器合并、展开、重命名和/或删除本地数据库。

    • 本地搜索比在线搜索快5-25倍。

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     金门克隆

    SeqBuilder Pro现在支持金门虚拟克隆,精确和无痕克隆。

    • 使用一个简单的向导设置克隆,该向导可以检测可能的故障并提供有用的反馈。

    • 查看克隆的所有组件的特性。

    • 轻松去除不需要的限制位点(domestication)。

    5

    用IQ树构建系统发育树

    MegAlign Pro现在包括IQ树算法,用于构建系统发育树。这种广泛使用的较大似然方法具有快速、准确和支持自助法的特点。

    • 从4种可用的系统发育计算方法中选择IQ-Tree。

    • 生成和比较由不同方法创建的多个树。

    • 自定义和导出您的系统发育树以供发布或协作。

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    如果您的DANStar许可在有效期内,即可更新到较新版本。如果想体验DNAStar较新版本的功能,欢迎联系科学软件网申请试用。


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