使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
科学软件网提供的软件覆盖各个学科,软件数量达1000余款,满足各高校和企事业单位的科研需求。此外,科学软件网还提供软件培训和研讨会服务,目前视频课程达68门,涵盖34款软件。
For example, with the click of a button you can convert 90 files, 45 pairs of forward and reverse sequences, into 45 contigs named according to your Patient IDs. A change in your sequence assembly parameters regroups your fragments, so you can assemble the contigs according to Clone ID, Date, Primer, or any other characteristic you record in your sequence names.
Clustal
Clustal[1] has been part of the Sequencher family of plugins since version 4.9. It is a widely used multiple-sequence alignment program which works by determining all pairwise alignments on a set of sequences, then constructs a dendrogram grouping the sequences by approximate similarity and then finally performs the alignment using the dendogram as a guide. You can use Clustal to align your sequences directly from the Sequencher project window. Choose from a range of parameters to control the alignment process.
Sequence AssemblyStringency
Sequencher's intuitive controls allow you to set your sequence assembly parameters and adjust them within seconds, allowing you to assemble your DNA fragments quickly and accurately. Sequencher will automatically compare the forward and the reverse-complement orientations to assemble the best possible contigs, so you can assemble DNA sequences regardless of orientation.
Apply Sequencher's versatile assembly tools to
Compare gene variants to a reference sequence
Confirm vector constructs
Assemble viral and bacterial genomes
Cluster tens of thousands of sequences from cDNA libraries
Assemble cDNA to genomic sequence
Create a primer map
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
在Sequencher中,您可以运行分析并以图形的形式查看结果。通常,差异表达式要求您从命令行安装和使用R统计编程语言。
我们给你一个菜单命令,允许你用火山图、散点图和条形图显示结果。每个点或条链接到它的隐藏数据,您可以点击一个您感兴趣的点或条,查看详细的结果。Sequencher中的Cufflinks suite包含Cuffquant和Cuffnorm。如果您没有做差异表达基因的工作,但仍然需要归一化的结果,那么在Cufflinks步骤后使用Cuffquant和Cuffnorm。如果需要减少计算机上的计算负载,您可以在Cufflinks和Cuffmerge步骤后使用Cuffquant来量化数据集中的读数。之后,用Cuffdiff来完成差异化分析。您会发现这一步要快得多,因为这部分工作已经完成了。
用基因名称或geneID搜索数据表,快速定位感兴趣的数据。排序并筛选数据,仅绘制您感兴趣的内容,然后以PNG格式导出图表,以便放到演示文稿或报告中。
科学软件网主要提供以下科学软件服务:
1、软件培训服务:与国内大学合作,聘请业内人士定期组织软件培训,截止目前,已成功举办软件培训四十多期,累计学员2000余人,不仅让学员掌握了软件使用技巧,加深了软件在本职工作中的应用深度,而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁;
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