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Primer Premier是一款由加拿大的Premier公司开发的用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计,评估的软件,其主要界面是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif)。
SNP基因型分析的引物设计
SNP基因型分析的引物设计
使用Primer Premier,您可以从dbSNP加载序列,并将所设计的引物并置在SNP选定的两侧。数百个未发表的SNPs也可以通过在标准GenBank/ dbSNP文件中它们作为变体特性来加载。在SNPs之后,引物设计可以增强他们使用probe-based化学检测。
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。
Generate Report
You can create a presentation quality report for the assays you designed for lab notebooks and for sharing information with colleagues. The report visualizes the positions of the primers on the sequence, includes a list of the alternate primers, displays primers, amplicon and sequence properties and the design parameters used by the primer design program.
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