Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以较少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sequencher 5.4.6新功能
为DNA序列分析提供了全新的和增强的功能。
Sanger
? Sequencher Connections中运行的 Primer-BLAST发送引物序列到您的Sequencher项目中。
? 在项目窗口中轻松使用一致性序列，作为NGS测序比对混合的参考序列。
? 新批量处理恢复结束命令。
? 在项目窗口中调整字体大小的功能。
NGS
? GSNAP和BWA-MEM工作流更快。
?构建GSNAP数据库和BWA索引，这些索引可以被重新用于与整个基因组的对齐。
?查看并保存用FastQC报告的NGS原始数据文件的质量分数和元数据。
?使用SAMtools在您的NGS校准中标记变量来生成不同的调用文件(VCF)。
RNA-Seq
? 随着Cuffquant和Cuffnorm的添加，扩展了Cufflinks套件的功能。
? Cuffdiff和 Cuffnorm*一**的Conditions and Replicates编辑器。
? 使用自定义排序和筛选选项来增强RNA-Seq可视化功能。
? 使用增强的外部数据浏览器轻松管理所有的DNA-Seq和RNA-Seq项目。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以较少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sequencher通用装配工具应用如下
? 基因变异与参考序列的比较
? 确认向量构造
? 组装病毒和细菌基因组
? 从cDNA库中集群数万个序列
? 将cDNA组合成基因组序列
? 创建引物图
组装参考
参考序列功能强大，它是测序和序列分析等的核心功能。无论您是从事法医学、系统研究、医学遗传学或人口研究，您都可能使用到参考序列功能。在GenBank格式中导入一个序列，将其特性表应用到序列中，并将其标记为一个引用序列。组装到参考序列意味着您可以将您的阅读和原型参考序列进行比较。如果您使用来自不同来源的多个示例，您甚至还可以按名称装配来自动化您的工作。
您甚至可以使用参考序列来指导去除您感兴趣区域之外的序列或者填补序列覆盖的空白。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以较少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
SNP检测
Sequencher有几个强大的工具来帮助你检测DNA序列中的突变和单核苷酸多态性。您可以使用Sequencher来对一组序列之间的比较序列比对或将1个或多个序列与参考序列进行比较。Sequencher的Call Secondary Peaks...功能分析您所有的潜在杂合子序列。控制杂合子的严格性是很*的。
您可以从一个杂合子导航到下一个，只需单击Basic视图中的空格键即可。查看蛋白质转换对于共识和参考序列低于共识。参考序列确保SNP的编号从一个DNA组件到下一个DNA组件是一致的。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以较少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sequencher的Reference Sequence是一个强大的功能，它控制着编号、特征以及更多的功能。与Variance Table结合一起使用，可以很*地确定您是在看已知的还是未报告的SNPs。使用Clustal，从Sequencher的项目桌面直接对齐序列。当有来自不同来源的多个样本时，您甚至可以使用Clustal的名称。创建工作报告，来自Variance Table的PDF报告，是一个分享您的信息的好方法，保存在您的实验室笔记中或者在演示文稿中使用。自定义工作区，控制窗口的位置，并使用标签来区分序列和重叠群。使用主题和**显示来识别序列区域。在模板中维持所有设置，以便您和您的同事可以使用相同的标准操作程序。
自定义工作区
可以自定义窗口的默认位置，Sequencher会记住您的设置格式和一致性选项。您还可以保存所有的设置，包括Reference Sequence,作为Project Template，可以重复使用，节省分析设置时间。
? 使用主题来**您定义的子序列
? 记住会话间的标尺设置
? 为您的工作风格选择较佳的窗口布局并保存它们
? 自定义项目窗口的显示
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