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HYDRUS可用来分析水质和溶质在非饱和、部分饱和或是饱和多孔介质情况下的运动。HYDRUS可由不规则边界处理水流区域，水流区域本身可能是由非均匀土壤组成具有局部各向异性任意程度。水流和运移可能发生在垂直面，也可能在水平面，具有径向对称性的垂直轴或三维区域。
模型的水流部分可以用来处理连续或时变的规定的方向和流量边界，以及由气象条件控制的边界。土壤表面边界条件在模拟从给定的流量到规定的方向类型条件期间可能会发生变化，反之亦然。它还可以通过水域饱和部分的剩余水量和不排水边界条件处理自由面边界。节点排水是由一个简单的模拟实验关系为代表。

对溶质运移来说，软件既支持连续和变化的规定浓度(Dirichlet或first-type)也支持浓度通量边界(Cauchy或third-type)。弥散张量包含分子扩散和曲折的结果反应影响。

不饱和土壤水文属性是由以下理论总结出来的，1980年的van Genuchten、1964年的Brooks 和Corey、1994年的Durner、1995年的Kosugi和修正的van Genuchten的型解析函数。这些修正内容对接近饱和状态的水利属性做了进一步的描述。HYDRUS软件包含了由1983年Scott et al.以及1987年Kool 和 Parker引进的结合实证模拟的滞变。 这个模型假定干燥扫描曲线是从主要干燥曲线衍生而来的，湿润扫描曲线是从主要湿润曲线衍生而来的。HYDRUS还包括1991年的Lenhard et al.和1992年Lenhard 和 Parker的滞变模型，它通过跟踪历史逆转点从而消除泵。HYDRUS在给定的土壤环境下可实行缩放过程已达到近似液压变化，通过一组线性标度变化工具，涉及个别土壤水力特性与参考土壤的关系。

使用应用到三角元素网络中的Galerkin的线性有限元方法来求解控制方程。饱和和不饱和的状态是通过有限差分格式集成实现的。结果方程是以迭代方式求解的，通过线性化和随后的高斯消元法对带状矩阵、对称矩阵的共轭梯度法或不对称矩阵正交较小化方法。额外的措施来提高瞬态问题的求解效率，包括自动时间步调整和确保Courant和 Peclet数字不**过预设水平。使用1990年Celia et al.提出的质量守恒法来评估水的含量。减少数值振荡上行重量作为求解运移方程的选项包含在里面。

Version 2.0, released in early May of 2011, is the first major upgrade of HYDRUS since 2006. In this version, we are expanding the four editions (Levels) which were available in version 1.x of HYDRUS, namely 2D-Lite, 2D-Standard, 3D-Lite, and 3D-Standard, with a new additional Level 3D-Professional. The 3D-Professinal Level will enable you to define transport domains of virtually arbitrary 3D shapes. Another major improvement that should significantly improve the effectiveness of working with HYDRUS is an option to specify various domain properties, and initial and boundary conditions, on Geometric Objects, rather than on FE-Mesh. We have also implemented two new solute transport modules (UNSATCHEM and Wetland) for evaluating the transport of major ions and for simulating processes in natural or constructed wetlands. There are also many other additional improvements and expansions of the model. Version 2.02, released in September 2012, offers three additional add-on modules: DualPerm for simulating two-dimensional variably-saturated water movement and solute transport in dual-permeability porous media, i.e., preferential and nonequilibrium water flow and solute transport, C-Ride for simulating two-dimensional colloid-facilitated solute transport, and HP2, which couples Hydrus (its two-dimensional part) with the PHREEQC geochemical code [Parkhurst and Appelo, 1999] to create this new comprehensive simulation tool (HP2 - acronym for HYDRUS-PHREEQC-2D), corresponding to a similar one-dimensional module HP1. Version 2.03, released in September 2013, uses new fonts improving the look of HYDRUS GUI on Chinese, Japanese and other similar Windows systems. This version also brings a number of new functions.

Slope Stability
Slope Classic附加模块的目的主要用于堤防的稳定性检查,水坝,削减地球和固定挡板结构。水的影响建模使用孔隙压力的分布,这是进口自动从水蛇座*时间的结果。每个时间步的水分布可以分别进行分析。
SLOPE Cube（Slope Stress and Stability）附件模块是由科罗拉多矿业大学的Ning Lu博士合作开发的。它使用一个统一的有效应力方法饱和和不饱和的条件。这个模块的目的是用来预测infiltration-induced滑坡启动和开展variably-saturated土壤条件下的边坡稳定性分析。


图形用户界面
一个基于微软Windows图形用户界面(GUI)管理的运行HYDRUS的输出需求，以及网格设计和编辑、参数配置、问题执行和结果可视化。HYDRUS还包括一组控件，允许用户创建一个流和运移模型，并对运行中的图形进行分析。使用空间和横截面查看和线图来检查输入和输出。HYDRUS图形用户界面的主程序单元定义了系统整体的计算环境。这个主模块控制程序的执行并确定哪些其他可选的工具是必要的。该模块还包含一个项目管理器和两个预处理和后处理单元。预处理单元包括所有必要的参数规格,如成功运行HYDRUS FORTRAN语言代码、相对简单的矩形和六面体传输域的网格生成器、用于非结构化有限元网格的复杂二维和三维域的网格生成器、一个小目录的土壤水力属性和从土壤结构数据的Rosetta Lite程序生成土壤水力属性。

自动生成有限元网格
数据预处理涉及二维流动区域规范，具有任意形状连续的折线、圆弧、样条函数、域边界的离散化和一个非结构化的有限元网格的下一个版本。HYDRUS（标准版）带有一个可选的网格生成程序，Meshgen可以生成一个非结构化有限元网格的二维域。HYDRUS基于Delaunay推论，已经被无缝集成到HYDRUS环境里了。在没有Meshgen程序的情况下，HYDRUS GUI提供了一个简单、结构化网格的自动构建选项(Lite版本)。三维版本是在Lite和Standard版本下添加了*的相同或不同厚度的层数。HYDRUS 3D专业版有一个三维网格生成程序(GENEX和T3D)，为通用三维域生成非结构化有限元网格。

HYDRUS is distributed in five different versions (Levels) so that users may acquire only that segment of the software that is most appropriate for their application. Users can select software limited to general two-dimensional applications (the 2D-Standard Level, which corresponds with former Hydrus-2D with MeshGen-2D) or for both two- and three-dimensional applications (i.e., 3D-Standard or 3D-Professional). Users can also opt for relatively simple (two-dimensional rectangular geometries – 2D-Lite [which corresponds with former Hydrus-2D without MeshGen-2D] or three-dimensional hexahedral geometries – 3D-Lite) or more complex geometries (i.e., 2D-Standard for general two-dimensional geometries, 3D-Standard for problems that can be defined using the general two-dimensional base and a layered third dimension, or 3D-Professional for applications with general three-dimensional geometries). Users may upgrade to higher Levels from lower Levels, as well as from lower versions (e.g., version 1.x) to higher versions (e.g., version 2 (and higher - in the future)).

HYDRUS可用来分析水质和溶质在非饱和、部分饱和或是饱和多孔介质情况下的运动。HYDRUS可由不规则边界处理水流区域，水流区域本身可能是由非均匀土壤组成具有局部各向异性任意程度。水流和运移可能发生在垂直面，也可能在水平面，具有径向对称性的垂直轴或三维区域。
模型的水流部分可以用来处理连续或时变的规定的方向和流量边界，以及由气象条件控制的边界。土壤表面边界条件在模拟从给定的流量到规定的方向类型条件期间可能会发生变化，反之亦然。它还可以通过水域饱和部分的剩余水量和不排水边界条件处理自由面边界。节点排水是由一个简单的模拟实验关系为代表。


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