功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex，您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示较佳可能的集合。
多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计较优的多重引物集，较大限度地减少Tm失配所有的集合进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择较适合您的实验需求的集合。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的*距离或序列内的任何地方。
对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（删除/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。
全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，较大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。
Multiplex PCR Primer Design
Designing primer sets that work well for a multiplex assay can be a challenging task. PrimerPlex uses innovative and proprietary algorithms to design optimal multiplex primer sets, minimizing Tm mismatches. All sets are analyzed for cross reactivity to ensure specific and efficient amplification. You can choose the set best suited for your experimental needs from a list of alternates presented in variously sortable order. Using PrimerPlex, you have the flexibility of designing primers either towards the 3' end, the 5' end, at a specified distance from these ends or anywhere within the sequence.
Next Generation Sequencing Assay
With PrimePlex, designing multiplex oligos for pre-sequencing sample preparation and mutation detection such as SNPs, DIPs (Deletion/Insertion Polymorphisms) and MNPs (Multiple Nucleotide Polymorphisms) is as easy as clicking a few buttons.
PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo设计
PrimerPlex是一种高效、复杂的工具，用于设计oligo并进行多重分析。多重分析促进了单个反应容器中多个目标的扩增，减少了实验的时间和成本。
多重PCR引物设计提出了几个挑战，其中包括引物二聚体、不能分离具有类似的电泳迁移率的扩增子以及由于非特异性结合非靶标DNA模板导致的引导错误。PrimerPlex使用专有算法，在**过100个序列的均匀反应条件下设计较优多重引物集。在池中筛选所有引物后，识别引物集合，并较大限度地减少Tm失配，以确保特定的放大和高信号强度。在这个过程中，它在几秒钟内分析了数百万个可能的多重引物集，并给出了一个备用集合的列表。您可以在设计的引物对中*较小产品尺寸差异，以更好地可视化凝胶上的条带。为了保证引物特异性，引物可以从PrimerPlex对NCBI中任何可用的基因组数据库进行BLAST搜索。
Multiplex SNP Detection and High Throughput Genotyping
Multiplex PCR Primer Design
Comprehensive Assay Support
Next Generation Sequencing Assay
添加MagPlex TAGs
该程序现在还支持一个MagPlex TAGs的数据库，以及MicroPlex xTAGs（以前称为FlexMAP TAGs），用于自动向每个ASPE引物添加适当的标签。标签是这样选择的，它们使二聚化较小化，并且不折叠在它们所附着的oligo上。此外，用户可以覆盖程序的建议，并自己选择标签。如果标签不是一的，或者选择的标签与oligo不兼容，PrimerPlex会向用户发出警报。
对于SNP的基因型研究，PrimerPlex设计了SNP的旁侧引物。其结果包括每个DNA模板的引物对，包括产品尺寸、退火温度等物理化学寡聚物性能。此外，二级结构的图形显示也可用以帮助确定它们是否会阻碍反应。
对于SNP的基因型分析，该程序设计了引物旁侧突变，如SNPs、DIPs（删除/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性）。
全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，较大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。
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