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许可形式单机版
原产地美国
介质下载
适用平台Windows
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TWINSPAN
TWINSPAN simultaneously classifies species and samples. At its core, TWINSPAN is based on dividing a reciprocal averaging ordination space. One of the most useful features of TWINSPAN is the final ordered two-way table. Species names are arrayed along the left side of the table, while sample numbers are along the top. The pattern of zeros and ones on the right and bottom sides define the dendrogram of the classifications of species and samples, respectively. The interior of the table contains the abundance class of each species in each sample. Abundance classes are defined by pseudospecies cut levels.
请注意,这种“不对称”的感觉不同于矩阵对称性。如果Legendre的非对称版本Gower的相似性被转换为距离(或相),并用于建立距离矩阵,这仍然是对称矩阵。换句话说,项目A和B之间的距离与B和A之间的距离相同,即使使用Gower的相似性的不对称版本。为了避免这种混乱,PC-ORD使用菜单系统中的术语"Gower, Ignore 0,0",并输出文
PC-ORD对电子表格中的生态数据进行多变量分析。PC-ORD的重点是非参数工具、图形表示、随机化测试和自举置信区间的社区数据分析。除了用于转换数据和管理文件的实用程序之外,PC-ORD还提供了许多统计数据包中不可用的排序和分类技术:CCA、DCA、指示物种分析、Mantel试验、部分Mantel试验、MRPP、PCoA、perMANOVA、RDA、双向聚类、TWINSPAN、Beals平滑、多样性指数、物种列表、许多排序叠加方法(定量、符号编码、颜色编码、网格、联合图、双情节、连续向量)、各种旋转方法、3D排序、Bray-Curtis排序、城市街区距离测量、物种面积曲线、树数据摘要、发布质量树图、自动驾驶模式的非度量多维范围(NMS或NMDS)。可以分析大型数据集。只要您计算机的内存够,大多数操作接受多32,000行或32,000列和多536,848,900个矩阵元素的矩阵。完整的手册包括上下文敏感的帮助系统。
等高线覆盖图
当您选择一个Q变量作为覆盖时,您会得到一个表格显示拟合是如何随柔韧度(平滑参数)变化而变化的,这个参数被用于非参数回归的覆盖变量而不是轴得分。如果您选择“Optimize” 柔韧度,PC-ORD会选择具有高交叉验证适合度(xR²)的柔韧度。如果您希望为柔韧度选择特定值,请选择"Specify"柔韧度。如果需要的话,使用“Optimize”下的表格来帮助您选择一个特定的柔韧度。后,您可以得到一个轮廓叠加到排序空间中,您还可以自定义,包括颜色阴影和/或轮廓间隔标记。
计算SU x形状矩阵
计算样本单元x特征矩阵提供了分析物种性状和解释变量之间关系的灵活的步。该矩阵是通过将样本单元x物种矩阵乘以物种x特征矩阵来获得的,但是矩阵所得到结果的内容,取决于性状是否标准化,以及乘法之后是否是加权平均步长(MCCUNE 2015)。为了大化SUX性状矩阵的通用性,包括性状之间的可比性,以及广泛的距离度量的可用性,我们建议首先将性状标准化为小至大,然后计算每个样本单位的丰度加权性状平均值。
NMS Scores
NMS Scores provides a prediction algorithm for non-metric multidimensional scaling (NMS). This is not prediction in the sense of forecasting, but rather statistical prediction in the same way as using multiple regression to estimate a dependent variable. NMS Scores calculates scores for new items based on prior ordinations.
19年来,公司始终秉承、专注、专心的发展理念,厚积薄发,积累了大量的人才、技术以及行业经验,在行业内得到了大量用户的认可和高度价。
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