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Bray-Curtis (Polar)
We offer numerous options and improvements beyond Bray and Curtis' original method, such as perpendicularized axes and variance-regression endpoint selection.
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Weighted Averaging
The simplest yet often effective method of ordination is weighted averaging. The essential operation is the same: a set of pre-assigned species weights (or weights for species groups) are used to calculate scores for sites (sample units). The calculation is a weighted averaging for species or species groups actually present in a sample unit. Weighted averaging used in Federal Manual and numerous ecological indices.
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基于距离的冗余分析(DBRDA)
基于距离的冗余分析(DRBDA)类似于冗余分析(RDA),除了主矩阵由它的主坐标代替,使用您选择的距离度量。这个变体的目的是允许您选择non-Euclidean距离度量,如Sorensen(Bray-Curtis),这个已经在群落生态学中是有效的。
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计算SU x形状矩阵
计算样本单元x特征矩阵提供了分析物种性状和解释变量之间关系的灵活的步。该矩阵是通过将样本单元x物种矩阵乘以物种x特征矩阵来获得的,但是矩阵所得到结果的内容,取决于性状是否标准化,以及乘法之后是否是加权平均步长(MCCUNE 2015)。为了大化SUX性状矩阵的通用性,包括性状之间的可比性,以及广泛的距离度量的可用性,我们建议首先将性状标准化为小至大,然后计算每个样本单位的丰度加权性状平均值。
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