GPMAW数据处理 保证正版
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产品描述

使用期限* 许可形式单机和网络版 原产地丹麦 介质下载 适用平台Windows
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Program content:
Documentation for GPMAW is presented in the HELP section, the manual is available for download here.
GPMAW数据处理
You deselect all regions by clicking once in the sequence without holding down the Shift key.
GPMAW数据处理
以上显示的,可以有多种配置方式:
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。
序列窗口形成父窗口,从中可以创建大量派生子窗口:
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表:疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是,也有其他方法,如手动或半自动分裂。
以及精美的图片都可以轻松完成。
GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
GPMAW数据处理
和*三个是从文献中得出的值(参考在线帮助和手册)。*二个选项基于游离残基的值。*四个和后一个选项基于当前选定的mass文件中的定义,必须选中才能使用这些值。
哪里使用这些值呢?
在各自的信息对话框中计算蛋白质和肽的PI值(从蛋白质或肽窗口,选择“蛋白质/肽信息)。如果选择了列选项,则在肽窗口中计算PI值。
模拟的2-D凝胶使用PI计算。
在DigestAlyzer中,可以选择Pi作为一个轴选项。
在肽窗口中报告电荷。
从蛋白质和肽窗口中调用电荷与ph窗口。
当前的局限
如果修改了带电残留物,则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值,则计算“正确”。如果一个界点被修改,它仍然会产生π/电荷。
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