正版软件 Beacon designer软件百科

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HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
Design specific and efficient oligos for all major qPCR assays
Design successful SYBR® Green, TaqMan®, HRMA Primers, MethyLight TaqMan®, LNA™ spiked TaqMan®, molecular beacons for both standard and NASBA® assays, Scorpions® and FRET assays by automatically interpreting BLAST results and avoiding template structures.

In addition to locating the primer anywhere on the gene of interest, Beacon Designer can design primers across exon-exon or exon-intron junctions. These primers designed across exon intron junctions help selective amplification of cDNA from gDNA.

You can use pre-designed or published or well proven forward or reverse primers and Beacon Designer™ will evaluate them for you. For example, for a given forward primer, Beacon Designer™ would design the reverse primer for SYBR® Green assays (and would design both the reverse primer and the TaqMan® probe for TaqMan® assays). All these primers are rated according to a ranking algorithm which determines how closely the specified primer pair and primer search parameters match the target values.

具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。


功能特征
SYBR Green引物设计
TaqMan探针设计
多路实时PCR检验设计
HRMA引物设计
MethyLight TaqMan设计
分子信标的设计
NASBA检验设计
FRET探针设计
Scorpions设计
避免交叉同源性-针对特定的Oligo设计
避免模板结构——提高引物效率
Oligo评级


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