AlleleID正版软件中文教程 正规代理

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Cross Species Detection
Changes in the DNA makeup of the organisms such as single nucleotide polymorphisms, during the course of evolution, have led to the diversity in phenotypic traits. Generations after generations, inherit these changes and contribute towards the biodiversity of species. Despite all these changes, there are still stretches of DNA which remain conserved during evolution. Such conserved regions or sequences are useful in suggesting phylogenetically similar groups, identification of an organism within a group or understanding the extent of its biodiversity amongst the flora of a particular area.

Design qPCR and Microarray Assays for Related Organisms
AlleleID® is a comprehensive desktop tool designed to address the challenges of bacterial identification, pathogen detection or species identification. With ClustalW multiple sequence alignment at its core, AlleleID® can be used to design species identification/cross species probes for microarrays or real time PCR including SYBR® Green, TaqMan® MGB, TaqMan® probes, Molecular Beacons and real time PCR primers. AlleleID® also offers support for designing microarray experiments for detecting alternative splicing events.

Y stands for the sequences that can be identified uniquely.

Species Identification Assays/Cross Species Assays/Allele Identification Assays
AlleleID® aligns sequences using ClustalW and analyzes conserved and species specific regions. You can then use the program for real time PCR primer design (SYBR® Green primer design included) and dual labeled probe design (TaqMan® probes, TaqMan® MGB probes and molecular beacons). These assays are designed to detect only the strain (strain detection) or species of interest from the mix.
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