本地化服务 ChromasPro云盘

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ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro适用于DNA序列组装项目，可达到几兆字节，并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器，比如ABI，454和Illumina下一代序列器中组装数据，如果有8GB的可用内存，则多可组装1,000,000个序列。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像，粘贴到文档或演示文稿中。
系统需求
Chromas is a free, simple, easy-to-use viewer and editor for chromatograms (traces) from automated Sanger sequencers. It has many format conversion options including batch processing functions to handle many files at once. As of version 2.6 it can use PeakTrace RP to enhance .ab1 files and extract more high-quality bases (this is a paid service). More…
ChromasPro is for assembly of sequence reads into contigs, with a graphical contig editor which displays aligned chromatograms. It also peforms general sequence analysis such as restriction enzyme mapping, open-reading-frame searches, and BLAST submission. More…

ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列，生成一致性并**模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图，并列出切割，非切割和片段。
映射开放阅读框，由G+C框架图，并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图，限制位点和片段图，和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像，粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro is suitable for DNA sequence assembly projects up to a few megabases, and basic sequence editing and analysis. It is able to assemble data from Sanger sequencers such as ABI, and 454 and Illumina next-generation sequencers, with up to 1,000,000 sequences if 8 Gb RAM is available. ChromasPro has the following features:

1、Applied Biosystems .ab1，Staden Chromatogram(SCF和ZTR)，454 SFF，FASTA，FASTQ，EMBL，GenBank，SwissProt，GenPept，GCG RSF和纯文本格式中的笔序列。
2、以.ab1，.scf，.fasta和.fastq格式保存序列。
3、使用图形界面组合重叠序列，生成共识并**显示编辑的歧义。
4、使用质量数据自动低质量序列以改进序列组装。
5、使用参考序列作为装配的支架。
6、生成限制性站点和片段映射，并列出切割器，非切割器和片段。
7、在G + C框架图的帮助下绘制开放阅读框，并一键翻译ORF。
8、打印色谱图，限制性位点和片段图，以及打开阅读框架图。
9、通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
10、通过与ClustalW连接来执行多重对齐。
11、反向和补体序列和色谱图。
12、通过匹配或佳比对搜索序列。
13、编辑核苷酸序列时显示翻译。
14、执行反向翻译并绘制核苷酸简并。
15、绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
16、复制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。


生成限制位点和片段图，并且列举切割、无切割和片段。
染色体图开放阅读框，借助G+C框架图，点击一下即可翻译ORFs。
打印色谱图，限制位点和片段图，并且打开阅读框架图。
执行核苷和蛋白质BLAST，通过NCBI搜索。
通过ClustalW的界面执行多序列。
逆向&补充序列和色谱图。
通过准确匹配或佳队列搜索序列。
当编辑核苷酸系列时显示翻译。
执行反向翻译和标出核苷酸退化。
划分蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱图截面的图形粘贴到文档或演示文件中。

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