放心购买 sequencher案例数据

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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Find Amino Acids
Sequencher中的Find Amino Acids命令允许快速识别数据中的个体或序列。使用单字母代码，插入您希望找到的，Sequencher会发现并**那些序列中的碱基。Sequencher通过在Find Amino Acids窗口选择Find Next按钮，可以轻松地进入符合搜索的下一组碱基。


方差表
SNP分析的有力工具
现在有一种非常简单的方法来比较DNA序列或重叠序列，并点击几下就可以找到这些序列之间的所有差异。方差表让您筛选大量的序列数据，这样您就可以快速可视化您感兴趣的碱基。方差表中的每个单元格都链接到其原始数据，因此您可以直接在表中直接验证或编辑每个假定的差异，并使序列和色谱数据自动更新。一旦发现所有差异，Sequencher会为您提供多种导出和报表选项。


转换方差表
转换方差表总结了选定的一组样品中的所有差异。因为表与底层序列数据相连，所以它是验证突变导致转换改变和检查表达载体的理想选择。
与将引用匹配为空白单元格的方差表不同，转换后的方差表以浅灰色显示匹配。这让您能看到密码子的差异，这些密码子仍然会导致的匹配。您甚至可以在复查模式中同时看到方差表和转换方差表，这样您就可以地确定哪一个DNA序列改变导致蛋白质序列改变。


报告
Sequencher输出报表创建数据的可打印版本。这些报告提供了分析工具，例如在人口报告中对类似样本进行聚类。人口报告是方差表中数据的总结。每个人口报告由两种类型的表组成：一个人口表和几个单的详细表，它们描述了人口表中的每个组。


Sequencher中方差详细报告提供了支持方差表的所有信息。与个别差异报告一样，汇总表列出每个样本或列的变体。另外，在差异详细报告中，详细表遵循所描述的变体中的每一个的变体表。本表中的详细内容包括序列名称、方向以及任何数据的碱基调用，有助于调用变体。如果置信度或色谱数据可用，这也包括在表中的每个序列中。色谱数据包括二次峰分布的细节和每个变体多达六个踪迹的色谱图，尽管每个变体的踪迹数量是可配置的。

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Maq
Maq是Sequencher v5.0时被添加到插件家族中的。流行的Maq算法将Next-Generation数据的单端和成对端对准参考序列。初设计为对齐Illumina-Solexa数据，可以对齐任何短的读取数据（63 bases或更少）。参考序列可能是FastA或GenBank的文件形式。Maq使用二进制格式压缩引用和读取文件。重要的是，Maq需要很少的内存来运行，这使得执行下一代测序更*。它也适用于大约二百万个阅读的小项目，尽管有可能把较大的项目拆掉，然后合并结果。您的对齐结果可以在Maqview或Tablet中查看。


初Maq是在命令行上运行的。Sequencher提供了一个简单、易于使用的接口，它可以保护您不受命令行的影响，也不必学习如何使用命令行参数。


SAMtools的变异调用
已经排序和对齐，接下来检查使用新的变体调用特征对变体进行对齐。您是否已经把您的读数与我们的参考引导对齐或者您已经将您的SAM/BAM文件导出到别处，您仍然可以使用SAMtools的变量调用检查变量。


此分析可用于SNP耐受性对齐、甲基化耐受性对齐或GSNAP中的新RNA A-I编辑耐受模式。然后将生成的VCF文件和SAM文件加载到您喜欢的浏览器中，如果您没有自己喜欢的浏览器，可以用Tablet—我们DNA-Seq工具分布的一部分。提供带有注释的GTF文件的Tablet，您还可以在特性中看到变体。

Assemble to Reference
The Reference sequence is a powerful feature, core to many aspects of sequencing and sequence analysis. Whether you are SNP hunting, engaged in Forensics, phylogenetic studies, medical genetics or population studies you will want to use the Reference Sequence feature.
Import a sequence in GenBank format and its feature table will be applied to the sequence, and mark it as a Reference Sequence. Assembling to the Reference Sequence means you are able to compare your reads to the archetypal Reference Sequence. If you are working with multiple samples from different sources you can even use Assemble by Name to automate your work.

In the NGS space, trust the accuracy of your work to peer-reviewed and published algorithms and tools such as GSNAP for reference-guided alignment, Velvet for de novo assembly, Cufflinks for RNA-Seq Differential Expression and Tablet for visualization. The design and effort that goes into Sequencher makes them easy to use because once you have learned how to use one, you have learned how to use them all.
2020年，北京天演融智软件有限公司申请高等教育司产学合作协同育人项目，“大数据”和“机器学习”师资培训项目，以及基于OBE的教考分离改革与教学评测项目已获得批准。我们将会跟更多的高校合作，产学融合协同育人。
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