使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
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With the addition of the Cufflinks suite you can perform RNA-Seq Differential Expression using the same style of interface we developed for all our NGS algorithms.
![sequencher序列号](//l.b2b168.com/2021/09/28/15/202109281523354477004.jpg)
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
De Novo Assembly
Velvet
Velvet是Sequencher v5.1时添加的插件,Velvet是一个的从头汇编程序,它不需要参考序列。Velvet包含两个程序。Velveth准备数据集时,Velvetg调用de Bruijn图形方法执行组装步骤。Velvetg构建重叠群,甚至尝试拼接重叠群。Velvet可以使用Multiplex ID数据来执行从头组装。Sequencher自动将数据按条形码分成单的文件(bins),然后将它们对齐,并将结果放入单的结果文件夹中。然后可以在Tablet浏览器中查看结果。每个重叠群的一致序列将出现在Project Window中。
Velvet在命令行上运行。Sequencher通过简单地单击几次来启动程序集运行,从而保护您不受命令行的影响。用户和新手都可以访问命令行参数来添加或更改参数,我们已经设置了一个新的GUI,让您访问和使用这些参数。
参考向导对齐
Aligners花费一定的时间索引参考序列来加速整体对齐。您可以创建和保留那些索引(BWA)或数据库(GSNAP),当您想用不同的参数来改进对齐或拼接时,可以提升它的速度。索引和数据库文件是跨平台的,因此您可以与不同类型计算机上的合作者共享它们。当您创建一个新的索引或数据库时,它将自动出现在该对齐程序的可用参考序列列表中,随时可供使用。
预处理引用的文件可以很大。当您不想使用哪个文件时,使用External Data Browser点击一下就可以删掉。如果需要再次索引相同的引用序列,则可以节省磁盘空间,而序列分析器可以轻松地重新创建它。
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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
SNP检测
Sequencher有几个强大的工具来帮助你检测DNA序列中的突变和单核苷酸多态性。您可以使用Sequencher来对一组序列之间的比较序列比对或将1个或多个序列与参考序列进行比较。Sequencher的Call Secondary Peaks...功能分析您所有的潜在杂合子序列。控制杂合子的严格性是很*的。
您可以从一个杂合子导航到下一个,只需单击Basic视图中的空格键即可。查看蛋白质转换对于共识和参考序列低于共识。参考序保SNP的编号从一个DNA组件到下一个DNA组件是一致的。
![sequencher序列号](//l.b2b168.com/2021/09/28/15/202109281523354472524.jpg)
Restriction Mapping
Sequencher provides a rich set of tools for generating linear restriction maps of your DNA sequence. Filter your enzyme selection by frequency, nature of the overhang, or length of recognition sequence.
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