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自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
具体而有效的设计:Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中,会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物,帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数,或者您可以使用默认值,在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
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双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质:
TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针,帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP(单核苷酸多态性)。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸(LNA)取代TaqMan探针,这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化,Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析,用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer,通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸,以及未经处理的DNA序列,可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质,您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列,给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术,可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。
Scorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的,它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。
FRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。
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可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物,帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数,或者您可以使用默认值,在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外,信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
双标记探针的设计
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HRMA Assay Design
Beacon Designer™ offers a comprehensive solution for mutation detection. High Resolution Melting Analysis (HRMA) is a more cost-effective method than probe-based genotyping analysis. The program employs proprietary algorithms that enables designing the best primers for detecting mutations.
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1、软件培训服务:与国内大学合作,聘请业内人士定期组织软件培训,截止目前,已成功举办软件培训四十多期,累计学员2000余人,不仅让学员掌握了软件使用技巧,加深了软件在本职工作中的应用深度,而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁;
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