Beacon designer正版软件使用教程 正版软件

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The DNA sample is first treated with sodium bisulphite which converts the unmethylated cytosine bases to . The methylated cytosines on the other hand, remain unaffected. Methyl Specific primers are designed to anneal with bisulphite converted DNA. This sample is amplified by PCR replacing the  with thymine. A TaqMan® probe is then used to detect the methylated strand.

双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
 TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
SYBR® Green Primer Design
TaqMan® Probe Design
Multiplex Real Time PCR Assay Design
HRMA Primer Design
MethyLight TaqMan® Design
Molecular Beacon Design
NASBA® Assay Design
FRET Probe Design

双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
Ÿ TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。

Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物，帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。



使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
Ÿ Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术，可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。


ŸScorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的，它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。


ŸFRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。


Ÿ多路实时PCR检验
有了Beacon Designer，您可以设计基于TaqMan的多路复用实时PCR检验，包括参考基因选择。


自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。

具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。

Beacon Designer 为qPCR检验设计和的oligos

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