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许可形式单机版
原产地美国
介质下载
适用平台Windows
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If the output file contains bonds between atoms, derived from population analysis (Mulliken or NBO), Chemcraft renders these bonds on the image of molecule, otherwise the bonds are identified automatically using the distance algorithm. If the checkbox "Show bond properties" is enabled for an individual element of the list, this is the evidence that the bonds have been read from the file for this geometry. For Gaussian computations, POP(NBO) must be specified in the input file for bonds to be printed in the output file. In GAMESS-US log files the bonds are usually printed; by default, only bonds with bond order not less than 0.25 are shown in the image (this value can be altered in "Tools/Preferences/Gamess").
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“拖曳”原子或沿键旋转碎片的例子
当“拖动”原子或执行其他结构修改时,任何几何参数都可以控制在图像上(见图5)。Chemcraft的界面允许人们轻松地改变任何原子的类型或插入/移除一个键。Chemcraft提供了快速获取Z矩阵的实用工具。Z矩阵是通过点击分子中的原子并一些附加信息来建立的(图7)。在使用这个工具之前,首先应该在Cartesian坐标中获得分子的结构。所有用于构建分子的上述工具都可用于此目的。
应用一组的几何参数
Z矩阵的可视化构造
Chemcraft可以调节分子中的原子坐标以应用特定的对称性(图8)。这个工具在研究中非常有用,因为对称分子比非对称分子计算得更快。
Chemcraft supports an interface for quick creation of sections of GAMESS-US input files with non-standard basis sets (fig. 4). The basis sets are extracted from their descriptions, which can be obtained at PNNL's webpage /forms/basisform.html). They can be also supplemented with additional gaussians specified by the user.
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Chemcraft对于Gamess用户
Chemcraft给Gamess-US输出文件提供了非常详细的可视化。文件中的下列数据可以以图形方式呈现:
原子坐标(对应于所有或对称的原子,如果在文件中呈现对应的表);
如果文件中给出了键阶分析,文件中的结合物显示在图像上(否则通过距离算法计算结合物);
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Chemcraft extracts tables of molecular orbital coefficients from the output files, which can be visualized in the form of isosurfaces or colored figures. The program can read orbitals from GAMESS/Gaussian output files and Gaussian Checkpoint files (.chk, .fch), as well as computed maps in Gaussian Cube files and ADF ASCII TAPE41 files. For Gaussian computations, "#P GFINPUT POP(FULL)" should be specified in input file, so that the orbitals and basis set information are printed in the output file.
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