使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
科学软件网提供的软件覆盖各个学科，软件数量达1000余款，满足各高校和企事业单位的科研需求。此外，科学软件网还提供软件培训和研讨会服务，目前视频课程达68门，涵盖34款软件。
We also added the charts you would expect to see, such as the Volcano plot, so you can view the results without resorting to the command line. Because we know you have your own favourite aligners we donÔÇÖt insist you use ours. As long as your aligner creates SAM or BAM as its output you are ready to explore your data with one of the most widely regarded RNA-Seq tools available.
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
MUSCLE
MUSCLE是一个多序列比对(MSA)程序，从5.1版本开始加入Sequencher插件。它加入了Clustal，使它成为了Sequencher DNS-Seq工具的*的MSA项目。它的速度和度都很好，与其他的多序列排列程序相比，它是非常有优势的。MUSCLE在排序过程中主要有四个主要的步骤。步是使用k-mer集群来构建一个距离矩阵，然后将其转换为树。第二步使用这棵树来一个渐进的对齐。在后的两个步骤中，MUSCLE算法尝试了许多不同的方法，以确定是否有可能改善树，从而实现多重对齐。
一旦整个过程完成，MUSCLE就会完成对齐，您会在Sequencher中看到以连续函数显示的结果。使用Sequencher的工具来注释您的对齐或导出您的对齐，并将其放入一个的系统遗传程序中。
MUSCLE是一个命令行程序，这意味着通常您会通过终端应用程序来使用这个程序。Sequencher开放了用户访问MUSCLE权限，而不需要学习使用UNIX命令行来操作。
限制性图
Sequencher提供了一套丰富的工具，用于生成DNA序列的线性限制图。通过频率、悬垂的性质或识别序列的长度来筛选酶的选择。
您还可以特定的向量和多连接序列来帮助您创建克隆策略。
支持信任值
Sequencher在项目窗口、序列编辑器和序列获取信息窗口中显示可信度和汇总置信度信息（如果在DNA序列文件中可用）。因此，您可以轻松地监视数据的质量。
您甚至可以为您的置信值截止范围，并通过颜色代码查看这些范围。
MUSCLE is a command line program, which means that normally you would be using this program through a Terminal application. Sequencher gives you access to MUSCLE’s power without the problems of learning to use the UNIX command line.
Sequencher's intuitive controls allow you to set your sequence assembly parameters and adjust them within seconds, allowing you to assemble your DNA fragments quickly and accurately. Sequencher will automatically compare the forward and the reverse-complement orientations to assemble the best possible contigs, so you can assemble DNA sequences regardless of orientation.
科学软件网不定期举办各类公益培训和讲座，让您有更多机会免费学习和熟悉软件。
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