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功能多样性
功能多样性分析了样本单元X物种矩阵与物种X性状矩阵的组合。功能多样性度量试图描述样本单元中所代表的物种功能性状的多样性，而是简单的物种多样性。例如，一个包含三个物种的情节，都具有相同的特征，被认为比单一物种更多样化。同样，两个具有非常不同功能性状的物种比其功能性状相似的两个物种具有更多的功能多样性。例如，如果一个图中有两个物种，一个是杂草丛生喜欢太阳的植物物种，另一种是耐荫能力较差的物种，这个图形比两个不同的物种都具有更多的功能多样性，它们都说耐荫性差的植物。
PC-ORD对电子表格中的生态数据进行多变量分析。PC-ORD的重点是非参数工具、图形表示、随机化测试和自举置信区间的社区数据分析。除了用于转换数据和管理文件的实用程序之外，PC-ORD还提供了许多统计数据包中不可用的排序和分类技术：CCA、DCA、指示物种分析、Mantel试验、部分Mantel试验、MRPP、PCoA、perMANOVA、RDA、双向聚类、TWINSPAN、Beals平滑、多样性指数、物种列表、许多排序叠加方法（定量、符号编码、颜色编码、网格、联合图、双情节、连续向量）、各种旋转方法、3D排序、Bray-Curtis排序、城市街区距离测量、物种面积曲线、树数据摘要、发布质量树图、自动驾驶模式的非度量多维范围（NMS或NMDS）。可以分析大型数据集。只要您计算机的内存够，大多数操作接受多32,000行或32,000列和多536,848,900个矩阵元素的矩阵。完整的手册包括上下文敏感的帮助系统。
新的分析方法
Ÿ *四角分析
通过样本单元x物种矩阵将物种性状与环境变量联系起来的方法学问题，因为是四个基本矩阵的排列（参看Dray和Legendre（2008，Fig.1a）以及McCune和Grace（2002,Fig.2.1）的性状x环境位置），因此被称为*四角问题。*四角分析提供了这些矩阵之间的链路强度的统计测试。对于*四角分析的理论和数学的详细解释见Legendre et al.(1997),Dray和Legendre(2008),Ter Braak et al,(2002)和Dray et al.(2004)。

PC-ORD: What’s New
Hilltop Plot
A hilltop plot is a way of showing more than one nonlinear response surface at a time.
More...

Morisita-Horn指数对小物种的影响较小，这在很大程度上是因为该方法抗欠采样的原因。同时，它使该方法对小物种携带的模式不敏感。
Ÿ 在perMANOVA和指示物种分析中增加块或组的大数目到1,000
Ÿ 新Summary | Write距离矩阵选项
Ÿ 物种面积曲线的自举置信区间
Ÿ PCA选项将预测方程写入文本文件
Ÿ PCA选项将特征值从随机化写入电子表格
Ÿ 使用Peres-Neto et al.(2006)方法在CCA中增加R²perm调整方差
Ÿ 使用Peres-Neto et al.(2006)方法在RDA中增加Ezekiel和R²perm调整方差
Ÿ 添加了拟合方法，包括基于随机的方法到NMS中
Ÿ Dust bunny指数从多元正态到dust bunny分布作为出发度量
Ÿ 新Summary | Write距离矩阵选项：
√ 只写次对角线距离（对于连续样本）
√ 写对子对角线距离（配对样本）


Canonical Correspondence Analysis (CCA)
CCA is unique among the ordination methods in PC-ORD in that the ordination of the main matrix (by reciprocal averaging) is constrained by a multiple regression on variables included in the second matrix.  In community ecology, this means that the ordination of samples and species is constrained by their relationships to environmental variables.  CCA is most likely to be useful when: (1) species responses are unimodal (hump-shaped), and (2) the important underlying environmental variables have been measured.
科学软件网主要提供以下科学软件服务：
1、软件培训服务：与国内大学合作，聘请业内人士定期组织软件培训，截止目前，已成功举办软件培训四十多期，累计学员2000余人，不仅让学员掌握了软件使用技巧，加深了软件在本职工作中的应用深度，而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁；
2、软件服务：提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务；
3、解决方案咨询服务：科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务；
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5、行业研讨服务：科学软件网会针对不**业，邀请国内外以及软件厂商技术人员，不定期在国内举办大型研讨会，时刻关注*技术，为国内行业技术发展提供导向。
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