PRIMER PREMIER怎么使用 诚信代理

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Edit Template Sequence
The template sequence can be edited. Bases can be modified using the standard Cut/Copy/Paste functions, to zero-in on the location of interest. Unwanted regions of sequences can be removed by selecting them and clicking Delete. The program also allows a user to add comments or annotations for the sequence for future reference.

Calculator
A built in calculator calculates the GC%, displays the base count and enables you to obtain the complementary and the reverse complementary strands.

You can evaluate a forward/reverse primer or a primer pair without even having to enter the template sequence. Primer Premier displays all the properties of the oligos being analyzed and exports them in an HTML or csv file format. The primers are ranked enabling you to judge how closely they meet the target values.

Primer Premier  PCR引物设计软件
自动同源性和避免模板结构
Primer Premier自动解释BLAST搜索结果，并避免那些区域设计与数据库具有显著交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示，并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构，可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠，在您的折叠温度下，程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中，二级结构形成的区域下面用横线强调，并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特，避免模板结构提高设计引物的效率。
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项，用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。
Evaluate Pre-designed Primers
Primer Premier analyzes and evaluates the properties of pre-designed primers and ranks them for you to adjudge how far the primers are from their desired target values. This feature is especially useful if you are working with published or pre-designed well proven primers. Primers with up to 5 mismatches can also be evaluated.
For a particular primer, Primer Premier can even design a compatible set. For example, for a pre-designed or published forward primer, Primer Premier can find a compatible reverse primer that meets all the design criteria.
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