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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sanger序列
Sequencher使传统的序列装配变得*,同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库,让一切变得更简单。通过直观的控制,您可以为数据选择佳算法,包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例,可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过,帮助您定位和处理模棱两可的问题,还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测,以提高数据结果的质量。
序列编辑
Sequencher提供一个DNA序列编辑工具,您需要确保这个序列是正确的。您可以在一个序列中查看一次您的色谱数据或在正向和反向方向查看多个对齐的色谱图。
它可以快速、方便地滚动对齐的数据,或者可以使用Sequencher的选择工具来**区域的差异或低质量。
Prior to executing a trim, Sequencher displays a graphic representation of the proposed trim, which allows you to even further refine your criteria.
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
多序列比对
Clustal
从4.9版本开始,Clustal已经成为Sequencher一系列插件的一部分。它是一种被广泛使用的多序列比对程序,它通过确定一组序列中的所有成对排列来进行工作,构造一个树状图以近似相似的方式对序列进行分组,然后使用dendogram作为向导来执行该序列。您可以使用Clustal来直接从Sequencher项目窗口中排列您的序列。从一系列参数中选择控制对齐过程。
一旦完成对齐,您可以看到Sequencher中一个或多个重叠的结果,您还可以进行多种分析。
通过将Clustal与Sequencher的功能结合起来,将不同来源的多个序列排列在一起,加速您的集群的排列。后以不同的格式导出文件,如MSF、Phylip、NEXUS和FastA,在其他程序中使用或者简单地创建一致性并导出。
Parallelize your analyses - use several different sets of settings and run on the same sequence or even different sequences at the same time without writing scripts.
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