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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
在Sequencher中,您可以运行分析并以图形的形式查看结果。通常,差异表达式要求您从命令行安装和使用R统计编程语言。
我们给你一个菜单命令,允许你用火山图、散点图和条形图显示结果。每个点或条链接到它的隐藏数据,您可以点击一个您感兴趣的点或条,查看详细的结果。Sequencher中的Cufflinks suite包含Cuffquant和Cuffnorm。如果您没有做差异表达基因的工作,但仍然需要归一化的结果,那么在Cufflinks步骤后使用Cuffquant和Cuffnorm。如果需要减少计算机上的计算负载,您可以在Cufflinks和Cuffmerge步骤后使用Cuffquant来量化数据集中的读数。之后,用Cuffdiff来完成差异化分析。您会发现这一步要快得多,因为这部分工作已经完成了。
用基因名称或geneID搜索数据表,快速定位感兴趣的数据。排序并筛选数据,仅绘制您感兴趣的内容,然后以PNG格式导出图表,以便放到演示文稿或报告中。
Assemble by Name is particularly helpful if you do a lot of sequencing and if you have numerous samples that are done with a standard set of sequencing primers. Some other applications of Assemble by Name can include:
Working with core labs that use structured naming conventions to track data for individual clients, we developed the Assemble by Name strategy that has become such a powerful and popular tool for combining multiple sequencing projects into a single analysis run.
Use Primer-BLAST to analyze sequences and check specificity.
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