使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows
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Design qPCR and Microarray Assays for Related Organisms
AlleleID® is a comprehensive desktop tool designed to address the challenges of bacterial identification, pathogen detection or species identification. With ClustalW multiple sequence alignment at its core, AlleleID® can be used to design species identification/cross species probes for microarrays or real time PCR including SYBR® Green, TaqMan® MGB, TaqMan® probes, Molecular Beacons and real time PCR primers. AlleleID® also offers support for designing microarray experiments for detecting alternative splicing events.

AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
的实验设计
AlleleID是一款旨在解决、病原体检测或物种的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心,AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
物种分析/跨物种实验/等位基因分析
AlleleID使用ClustalW对序列进行排列,并分析保存和物种特定区域。您可以使用程序进行实时PCR引物设计(包含SYBR Green引物设计)和双标签探针设计(TaqMan probes,
TaqMan MGB and molecular beacons)。这些检测方法只用于进行菌株检测或从混合菌株中找到感兴趣的物种。为了进行交叉物种试验,AlleleID通过识别保守区域来设计通用探针。对于相关的生物体,当研究物种的基因组草图不可用时,可以使用AlleleID来研究其基因表达。这些强大的功能可以帮助解决了很多具有挑战性的难题,例如的检测、、定量以及污染物、环境等的监测。

设计Luminex xMAP试验
基于Luminex’s xMAP技术,AlleleID可以设计应用于悬浮阵列系统的应变-微分多重分析设计。如果您研究的是密切相关的生物体,这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特引物延伸(ASPE)和DHA检测。
多路连接依赖探针扩增(MLPA)检测拷贝数和突变检测
AlleleID是设计MLPA合成探针或者由MRC Holland引入的多重连接依赖探针扩增技术的程序,当合适的工具包不可用时,研究人员能够扩展这项技术。这是一种快速增长的高通量基因图谱分析方法。可以检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。具有成本效益合适、敏感性高、特好和可再生性好等特点。
AlleleID为PamGene检测设计了mRNA特,DNA特和突变特MLPA探针。这将使PamChip用户在使用PamGene高精度检测平台时设计自己感兴趣的基因探针检测。结合这两种技术,拷贝数的变化和突变可以很*地在6小时内检测到。

SYBR® Green is the most widely used double-strand DNA-specific dye reported for real time PCR. SYBR® Green binds to the minor groove of the DNA double helix. In the solution , the unbound dye exhibits very little fluorescence. This fluorescence is substantially enhanced when the dye is bound to double stranded DNA. SYBR® Green remains stable under PCR conditions and the optical filter of the thermocycler can be affixed to harmonize the excitation and emission wavelengths. Ethidium bromide can also be used for detection but its carcinogenic nature renders its use restrictive.
2020年,北京天演融智软件有限公司申请高等教育司产学合作协同育人项目,“大数据”和“机器学习”师资培训项目,以及基于OBE的教考分离改革与教学评测项目已获得批准。我们将会跟更多的高校合作,产学融合协同育人。
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