使用期限*
许可形式单机和网络版
原产地丹麦
介质下载
适用平台Windows
科学软件网提供的软件覆盖各个学科,软件数量达1000余款,满足各高校和企事业单位的科研需求。此外,科学软件网还提供软件培训和研讨会服务,目前视频课程达68门,涵盖34款软件。
以上显示的,可以有多种配置方式:
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。
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当前的局限
如果修改了带电残留物,则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值,则计算“正确”。如果一个界点被修改,它仍然会产生π/电荷。
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除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
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GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库,从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中,以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列),以便于传输到其他程序。
质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave,电荷- Bull&Breese指数,HPLC指数,pI,电荷),并可以进一步工作(如交联,新的分裂)。
生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分,但是在以前的版本中,您必须自己安装。
The GPMAW program is primarily intended as a tool for mass spectrometric analysis of proteins and peptides. However, a number of other bioinformatics tools have been included, so the use of the program extends far beyond simple mass analysis.
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