使用期限租赁版
许可形式单机版
原产地美国
介质下载
适用平台Windows
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系统需求
Chemcraft适用于Windows和Linux系统。
Chemcraft提供了输出文件以结构化的形式呈现。被读取的文件被分成单的元素,例如单的几何形状或振动模式。对于每个元素,从文件中提取所有可用数据:原子坐标、能量梯度等。所有元素都呈现在分层列表中(图1)。单击列表中的元素自动显示图像上的单几何或模式,并允许显示不同的属性。该接口提供了计算数据的可靠可视化,包括非标准类型的计算、不完整的计算等。它还允许具有多个计算任务的复杂文件被可视化。对于能量扫描或IRC计算,通过扫描/IRC步骤将所有几何结构分成组。除了图形的数据表示之外,Chemcraft概述了输出文件的基本部分,并为文件的每个元素显示了一个简短的“摘要”。
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分子结构合并
Chemcraft支持一组用于构造分子结构的工具,这些工具可用于准备计算或其他目的的初始猜测。
在使用该实用程序之前,应该选择几个原子以大程度地彼此靠近(图9这些原子标记为白色)。除了这个特性,Chemcraft还可以计算两个分子之间的均方根差值。
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Chemcraft提供了输出文件以结构化的形式呈现。被读取的文件被分成单的元素,例如单的几何形状或振动模式。对于每个元素,从文件中提取所有可用数据:原子坐标、能量梯度等。所有元素都呈现在分层列表中(图1)。单击列表中的元素自动显示图像上的单几何或模式,并允许显示不同的属性。该接口提供了计算数据的可靠可视化,包括非标准类型的计算、不完整的计算等。它还允许具有多个计算任务的复杂文件被可视化。对于能量扫描或IRC计算,通过扫描/IRC步骤将所有几何结构分成组。除了图形的数据表示之外,Chemcraft概述了输出文件的基本部分,并为文件的每个元素显示了一个简短的“摘要”。
Chemcraft从Gamess-US输出文件中提取分子轨道系数和基组信息,以等密度面的形式呈现分子轨道或由密度值着色的表面(平面、球体)(参加图3)。Chemcraft提供用轨道执行操作的一些可能性(例如将一个轨道乘以另一个轨道)。创建轨道的公式取自GAMESS-US分发的PLTROB程序的源代码。用密度值计算立方体能被很好地优化。注意,如果文件中有多个分子轨道系数表,Chemcraft可以提取它们中的每一个并允许它们被渲染(例如,在MCSCF计算中,可以显示规范或自然轨道)。除了轨道的可视化,Chemcraft还提供了一个简单实用的工具,用于自动确定原子轨道形成每个分子轨道,这对分析轨道很有用。
Chemcraft支持一个接口,用于快速创建具有非标准基组的GAMES-US输入文件的部分(图4)。从它们的描述中提取基集,可以在PNNL的网页上获得
/forms/basisform.html)。她们还可以由用户gaussians来补充。
Chemcraft从NMR计算(GIAO,CSGT)的Gaussian日志文件中读取各向同性屏蔽值。提供了一种简单的工具,用于将它们重新描述成化学位移和在原子组内的平均值。
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Chemcraft can calculate root-mean-square distances between the Cartesian coordinates of two molecular structures ("Tools/RMS compare structures" menu item, see here). Besides that, the program can merge multiple structures to allow the user to visually see the difference between them.
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