正规代理 sequencher正版软件怎样用

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Trim Vector removes sequence-specific data contaminating the ends of your sequences.

MUSCLE is said to have four major steps in its alignment process. The first step constructs a distance matrix between pairs of sequences using k-mer clustering, this is then converted into a tree. The second step uses this tree to guide a progressive alignment. In the final two steps, the MUSCLE algorithm tries a number of different methods to see if it is possible to improve the tree and hence the multiple alignment.

Trim to Reference eliminates the ends of sequences that extend beyond an assembled Reference sequence.

Sequence Trimming
Automated DNA sequencers occasionally produce poor quality reads, particularly near the sequencing primer site, and toward the end of longer sequence runs. The sequences of clones from DNA libraries frequently contain vector sequence, polyA tails, or other unrelated sequence. Introns and primer sequence frequently flank the sequence of amplified exons. Unless removed by trimming, any of these artifacts will distort your sequence assembly and downstream sequence analysis.
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