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原产地美国
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"I found Primer Premier very sophisticated and a great software to use. I successfully designed primers for Human and Avian Genetic studies." -Ms. Amal Korrida, PhD Candidate, IFCDW Genetics Department, Morocco.
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Evolution of Enterohemorrhagic Escherichia coli O26 Based on Single-Nucleotide Polymorphisms Stefan Bletz, Martina Bielaszewska, Shana R. Leopold, Robin Köck, Anika Witten, Jörg Schuldes, Wenlan Zhang, Helge Karch, Alexander Mellmann.
Genome Biology and Evolution. 2013;5(10):1807-16. doi: 10.1093/gbe/evt136.
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PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo设计
功能
多重SNP检测和高通量基因型
使用PrimerPlex,您可以设计SNP在旁侧的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕获探针。PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo,来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用,并显示佳可能的。
多重PCR引物设计
设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计优的多重引物集,大限度地减少Tm失配所有的进行交叉反应分析,以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的各种排序顺序中选择适合您的实验需求的。使用PrimerPlex,您可以灵活地设计引物,无论是朝向3'端,还是5'端,在这些端点的距离或序列内的任何地方。
对于SNP的基因型分析,该程序设计了引物旁侧突变,如SNPs、DIPs(/插入多态性)和MNPs(多核苷酸多态性)。
全面的分析支持
使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性,以确保高信号强度,大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。
Features
Multiplex SNP Detection and High Throughput Genotyping
With PrimerPlex, you can design multiplex PCR primers flanking the SNP, ASPE primers with SNPs at the 3' end and capture probes with SNPs at their center. PrimerPlex enables you to detect all the mutations of a medium sized genomic sequence by designing oligos for each one of them. These primers and probes are checked for multiplexing and the best possible set is displayed.
Multiplex PCR Primer Design
Designing primer sets that work well for a multiplex assay can be a challenging task. PrimerPlex uses innovative and proprietary algorithms to design optimal multiplex primer sets, minimizing Tm mismatches. All sets are analyzed for cross reactivity to ensure specific and efficient
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Exploring target-specific primer extension in combination with a bead-based suspension array for multiplexed detection and typing using Streptococcus suis as a model pathogen
Fimme J. der Wal, René P. Achterberg, Conny Solt-Smits, Jan H. W. Bergervoet, Marjanne de Weerdt, Henk J. Wisselink.
Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 2018; Jan; 30(1): 71–.
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