正版软件 GPMAW正版软件购买
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产品描述

使用期限* 许可形式单机和网络版 原产地丹麦 介质下载 适用平台Windows
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Main toolbar – Seach & cleavage section:
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以上显示的,可以有多种配置方式:
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。
序列窗口形成父窗口,从中可以创建大量派生子窗口:
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表:疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是,也有其他方法,如手动或半自动分裂。
以及精美的图片都可以轻松完成。
GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
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序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库,从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中,以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列),以便于传输到其他程序。

质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave,电荷- Bull&Breese指数,HPLC指数,pI,电荷),并可以进一步工作(如交联,新的分裂)。

生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分,但是在以前的版本中,您必须自己安装。
序列窗口
序列窗口是GPMAW的核心窗口并默认显示一个序列。从这里,您可以调用大多数与序列相关的函数(通过菜单、工具栏或弹出菜单)。

Sequence handling: Import of sequences from a number of different formats with direct database search in Entrez and in local databases (FastA format and Swiss-Prot). Sequences can be saved in local files (databases) for future reference.
From the sequence window a large number of actions can be performed. Sequences can be exported in FastA format (either singly or all sequences at once) for easy transfer to other programs.
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等

通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。

序列窗口形成父窗口,从中可以创建大量派生子窗口:
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表:疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮

肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是,也有其他方法,如手动或半自动分裂。

Sequence window
The sequence window is the central window of GPMAW and default view of a sequence. From here you can call most of other sequence related functions (either through the menu, the toolbar, or the pop-up menu).



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The next two buttons show the status of the N- and C-terminal respectively (click to edit).
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