PRIMERPLEX入门到精通 正规代理

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Public Health Value of Next-Generation DNA Sequencing of Enterohemorrhagic Escherichia coli Isolates from an Outbreak
Anthony P. Underwood, Tim Dallman, Nicholas R. Thomson, Michaela Williams, Katy Harker, Neil Perry, Bob Adak, Geraldine Willshaw, Tom Cheasty, Jonathan Green, Gordon Dougan, Julian Parkhill, John Wain.
Journal of Clinical Microbiology. 2013; Jan; 51(1): 232–237.doi: 10.1128/JCM.01696-12.

A Comprehensive PCR Primer Design Software
Primer Premier's search algorithm finds optimal PCR, multiplex and SNP genotyping primers with the most accurate melting temperature using the nearest neighbor algorithm. Primers are screened for secondary structures, dimers, hairpins, homologies and physical properties before reporting the best ones for your sequence, in a ranked order. Load the gene of interest from NCBI, select a search range, sit back and let Primer Premier pick the best possible primers for you.

We are very satisfied with the software and the LNA probes we designed using Beacon Designer™ are working wonderfully." -Dr. Steven M. Short, Assistant Professor, Department of Biology, University of Toronto Mississauga.

PrimerPlex  多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo设计
下一代测序分析
使用PrimePlex设计多重oligos，用于预先测序的样品制备和突变检测，如SNPs，DIPs（/插入多态性）和MNPs（多核苷酸多态性），就像点击几个按钮一样简单。
引物特
程序BLAST搜索在单个搜索运行中搜索多个序列。结果会自动解释，并在引物设计中避免识别出现的同源性，从而确保设计是高度特异的。
评估预设计的引物和探针
PrimerPlex可以使用预先设计的经过验证的oligos来构建复用集。在为每个序列了oligo之后，对它们的属性进行分析，并为发现的任何偏差提醒用户。对于预先设计的oligos不可用的序列，PrimerPlex设计它们，检查它们是否复用，并强调兼容性问题。然后用户可以决定接受这个设计或者创建一个单的池。这个功能在用户的手中提供了完全的控制。
添加MagPlex TAGs
该程序现在还支持一个MagPlex TAGs的数据库，以及MicroPlex xTAGs（以前称为FlexMAP TAGs），用于自动向每个ASPE引物添加适当的标签。标签是这样选择的，它们使二聚化小化，并且不折叠在它们所附着的oligo上。此外，用户可以覆盖程序的建议，并自己选择标签。如果标签不是的，或者选择的标签与oligo不兼容，PrimerPlex会向用户发出警报。
Next Generation Sequencing Assay
With PrimePlex, designing multiplex oligos for pre-sequencing sample preparation and mutation detection such as SNPs, DIPs (Deletion/Insertion Polymorphisms) and MNPs (Multiple Nucleotide Polymorphisms) is as easy as clicking a few buttons.
Primer Specificity
The program BLAST searches multiple sequences in a single search run. The results are automatically interpreted and the homologies identified are avoided during primer design, ensuring that the design is highly specific.
科学软件网主要提供以下科学软件服务：
1、软件培训服务：与国内大学合作，聘请业内人士定期组织软件培训，截止目前，已成功举办软件培训四十多期，累计学员2000余人，不仅让学员掌握了软件使用技巧，加深了软件在本职工作中的应用深度，而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁；
2、软件服务：提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务；
3、解决方案咨询服务：科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务；
4、软件升级及技术支持服务：科学软件网可向用户提供软件的本地化技术支持服务，包括软件更新升级、软件故障排除、安装调试、培训等;
5、行业研讨服务：科学软件网会针对不**业，邀请国内外以及软件厂商技术人员，不定期在国内举办大型研讨会，时刻关注*技术，为国内行业技术发展提供导向。
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