使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows,mac
科学软件网销售软件达19年,有丰富的销售经验以及客户资源,提供的产品涵盖各个学科,包括经管,仿真,地球地理,生物化学,工程科学,排版及网络管理等。此外,我们还提供很多附加服务,如:现场培训、课程、解决方案、咨询服务等。
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
在Sequencher中,您可以运行分析并以图形的形式查看结果。通常,差异表达式要求您从命令行安装和使用R统计编程语言。
我们给你一个菜单命令,允许你用火山图、散点图和条形图显示结果。每个点或条链接到它的隐藏数据,您可以点击一个您感兴趣的点或条,查看详细的结果。Sequencher中的Cufflinks suite包含Cuffquant和Cuffnorm。如果您没有做差异表达基因的工作,但仍然需要归一化的结果,那么在Cufflinks步骤后使用Cuffquant和Cuffnorm。如果需要减少计算机上的计算负载,您可以在Cufflinks和Cuffmerge步骤后使用Cuffquant来量化数据集中的读数。之后,用Cuffdiff来完成差异化分析。您会发现这一步要快得多,因为这部分工作已经完成了。
用基因名称或geneID搜索数据表,快速定位感兴趣的数据。排序并筛选数据,仅绘制您感兴趣的内容,然后以PNG格式导出图表,以便放到演示文稿或报告中。
![sequencher软件教程教你怎么用](//l.b2b168.com/2022/08/18/14/202208181418104913204.jpg)
Automated Analysis
Sequencher batch processes your DNA sequence data in a way that is transparent, user definable, and recoverable, and Sequencher never jeopardizes the validity of your scientific conclusions for the sake of automation. Sequencher always gives you the final choice in your sequence editing.
![sequencher软件教程教你怎么用](//l.b2b168.com/2021/09/28/15/202109281523356415044.jpg)
Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年,Sequencher提供了**的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
FastQC质量控制报告
在开始调整数据之前,先停下来考虑一下,我们的数据到底如何?现在我们可以用FastQC Quality Reports。我们在Sequencher中添加了FastQC程序。从Sequence > Analyses > FastQ Quality Report…启动此功能,您可以得到多达12种不同的度量结果。从‘Per base sequence quality’ 到‘Kmer Content’,从Sequence Duplication Levels’ 到 ‘Overrepresented sequences’,结果给出一个易于理解的交通灯系统图以及更详细的图表。
在组装前,使用报表个人数据集的质量,或随时质量。
RNA-Seq
RNA-Seq实验正在为蛋白质编码转录物的研究带来新的理解和知识,是否从不同时间点或在正常状态和疾病状态之间的正常组织。Sequencher家族新的程序是Cufflinks suite,研究RNA-Seq NGS数据的一系列程序。使用您喜欢的aligner对齐RNA-Seq NGS数据到参考序列中,然后使用SAM或BAM结果文件和参考GTF文件来启动Cufflinks。重点使用Cufflinks, Cuffmerge, Cuffdiff以及终数据以表格和图形展示这四个步骤过程的差异表达。Cufflinks suite命令行程序可以使用我们易于使用的图形界面。对于终控件,您也可以访问所有命令行函数,通过简单的点,然后单击Advanced(Edit)对话框。
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Sequencher's intuitive controls allow you to set your sequence assembly parameters and adjust them within seconds, allowing you to assemble your DNA fragments quickly and accurately. Sequencher will automatically compare the forward and the reverse-complement orientations to assemble the best possible contigs, so you can assemble DNA sequences regardless of orientation.
19年来,公司始终秉承、专注、专心的发展理念,厚积薄发,积累了大量的人才、技术以及行业经验,在行业内得到了大量用户的认可和高度价。
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