本地化服务 sequencher软件教程教你安装软件

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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sequencher通用装配工具应用如下
Ÿ 基因变异与参考序列的比较
Ÿ 确认向量构造
Ÿ 组装病毒和基因组
Ÿ 从cDNA库中集群数万个序列
Ÿ 将cDNA组合成基因组序列
Ÿ 创建引物图


组装参考
参考序列功能强大，它是测序和序列分析等的核心功能。无论您是从事法、系统研究、遗传学或人口研究，您都可能使用到参考序列功能。在GenBank格式中导入一个序列，将其特性表应用到序列中，并将其标记为一个引用序列。组装到参考序列意味着您可以将您的阅读和原型参考序列进行比较。如果您使用来自不同来源的多个示例，您甚至还可以按名称装配来自动化您的工作。


您甚至可以使用参考序列来去除您感兴趣区域之外的序列或者填补序列覆盖的空白。

MUSCLE is a command line program, which means that normally you would be using this program through a Terminal application. Sequencher gives you access to MUSCLE’s power without the problems of learning to use the UNIX command line.

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
BMA
BWA是Sequencher v5.2时添加到插件家族中的。Sequencher使用BWA-MEM， BWA软件包包含了快新的算法。BWA-MEM被设计为对齐70bp到1Mbp的序列读数到参考序列中。BWA在命令行中运行。Sequencher为您提供了一个易于使用的接口，它可以使您与命令行隔离，并且不必学习或使用命令行参数。用户想要访问这些命令行函数，Advanced (Edit)对话框也允许您使用这些命令行。


GSNAP
GSNAP是Sequencher v5.0被添加到插件家族中。GSNAP使用压缩参考序列的基准参考对准的方法。当执行Next-Gen序列时，让GSNAP可以更快更简单。


GSNAP被设计用来执行Illumina-Solexa的基于参考对准和Sanger标准数据，这个标准数据是成对结尾或未成对结尾的。在GSNAP中，序列的长度不是问题，因为它可以在非常短的时间内与任意长的数据长度对齐。GSNAP可以处理Multiplex ID（MID）数据，从而进一步提高工作效率。Sequencher友好的界面允许您使用MID数据来发挥GSNAP的功能。Sequencher自动将数据按条形码分割成单的文件，使用GSNAP将它们与引用对齐，并将结果放入单的结果文件夹中。


用GSNAP进行任何对齐的结果可以在流行的Tablet浏览器中查看。

Trim Vector removes sequence-specific data contaminating the ends of your sequences.
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