使用期限*版
许可形式单机版
原产地美国
介质下载
适用平台Windows
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HRMA Assay Design
Beacon Designer™ offers a comprehensive solution for mutation detection. High Resolution Melting Analysis (HRMA) is a more cost-effective method than probe-based genotyping analysis. The program employs proprietary algorithms that enables designing the best primers for detecting mutations.
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You can use pre-designed or published or well proven forward or reverse primers and Beacon Designer™ will evaluate them for you. For example, for a given forward primer, Beacon Designer™ would design the reverse primer for SYBR® Green assays (and would design both the reverse primer and the TaqMan® probe for TaqMan® assays). All these primers are rated according to a ranking algorithm which determines how closely the specified primer pair and primer search parameters match the target values.
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具体而有效的设计:Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中,会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
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可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物,帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数,或者您可以使用默认值,在经过大量的研究和与的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外,信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析(HRMA)是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法,可以设计出检测突变的佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变,产生具有可检测的熔融温度变化的短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构,保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索,以检验其特。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
双标记探针的设计
19年来,公司始终秉承、专注、专心的发展理念,厚积薄发,积累了大量的人才、技术以及行业经验,在行业内得到了大量用户的认可和高度价。
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