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许可形式单机和网络版
原产地丹麦
介质下载
适用平台Windows
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Select File|Open or click on the ‘Open file’ icon. This opens the ‘Open sequence library’ dialog:
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Every 10th residue is labeled with the residue number as a subscript when showing 3-letter residue code (divided by 10, i.e. residue 120 is labeled with 12) or as a small tick mark when showing 1-letter code. The feature can be turned off Setup. Use the 1/3 button in the toolbar to switch between 1- and 3- letter code.
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肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:
The display can be configured in multiple ways:
1- or 3-letter display,
average mass/monoisotopic mass,
fixed residue width,
sidebar with sequence information,
display disulfide bridges, modified residues etc.
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The colors of the displayed residues can be changed for easier navigation and to indicate modifications and changes More.
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